Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 HNRNPR-202ENST00000374612 2694 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 CDKL3-201ENST00000265334 2130 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 ZSCAN31-214ENST00000446474 2562 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 CCDC126-201ENST00000307471 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 NKTR-201ENST00000232978 7343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 THAP5-203ENST00000415914 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 LINC00661-204ENST00000549354 3340 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 UQCC1-205ENST00000374385 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 USP3-202ENST00000380324 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 ITGA10-201ENST00000369304 5269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 TSNAX-DISC1-205ENST00000602962 3557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 NAGA-203ENST00000403363 1856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 LINC01977-201ENST00000576963 1788 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 ATP8B5P-204ENST00000439972 2522 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 PRC1-201ENST00000361188 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 NUP98-205ENST00000397007 3698 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 ZNF619-203ENST00000432264 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 LRTOMT-202ENST00000307198 3604 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 FRG2B-202ENST00000443774 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 AC138627.1-203ENST00000641872 1680 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 NFIA-207ENST00000403491 9487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 PPY-201ENST00000225992 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 TRBV6-5-201ENST00000390368 410 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 AL161740.1-201ENST00000417420 610 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 AC013460.1-205ENST00000450695 518 ntTSL 4 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 AC009229.1-201ENST00000450854 622 ntTSL 4 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 AC013472.1-202ENST00000455081 558 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 AC107421.1-201ENST00000477300 404 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 RPL7AP26-201ENST00000488538 813 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 LINC02221-201ENST00000508097 499 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 TRPC7-AS2-201ENST00000513958 706 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 RN7SKP196-201ENST00000516267 345 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 IGKV2OR22-3-201ENST00000521969 360 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 MBP-228ENST00000527041 582 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 AC079363.1-201ENST00000551366 1125 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 LINC02137-201ENST00000561906 644 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 MIR4419A-201ENST00000583845 77 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 LAMTOR5-AS1-211ENST00000598350 749 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 RN7SL760P-201ENST00000607344 270 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 MIR7973-1-201ENST00000614683 76 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 AC244153.1-204ENST00000615582 401 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 PPARGC1A-218ENST00000617484 1026 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 AC106875.2-201ENST00000617634 596 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 AL109804.1-201ENST00000620777 562 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 AL355480.4-201ENST00000626823 69 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 ZNF610-207ENST00000601151 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 C15orf39-201ENST00000360639 4517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 DNAJC16-203ENST00000375849 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 MITF-202ENST00000314589 1993 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 GABPB1-203ENST00000380877 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 KBTBD6-201ENST00000379485 5178 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 FOPNL-201ENST00000255759 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 SRP72-201ENST00000342756 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 AC022148.1-201ENST00000316807 3267 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 ADAL-203ENST00000428046 3514 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 PAXBP1-AS1-201ENST00000440052 3523 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 FAM198B-202ENST00000393807 4544 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 UVRAG-207ENST00000531818 3152 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 SEH1L-201ENST00000262124 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 SLC34A2-201ENST00000382051 4122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 CHODL-206ENST00000400135 2136 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 RAP1GAP2-202ENST00000366401 6616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 CLCC1-206ENST00000369970 2078 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 NIN-201ENST00000245441 10293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 BRD1-203ENST00000404760 4550 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 IL20RB-201ENST00000329582 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 GIN1-201ENST00000399004 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 NPY2R-202ENST00000506608 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 LRRC7-201ENST00000035383 5000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 TBC1D14-206ENST00000446947 4021 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 ZNF438-204ENST00000413025 3106 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 RAB3GAP2-202ENST00000358951 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 NCOA4-202ENST00000579039 2211 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 APOL4-201ENST00000328429 844 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 AC006455.4-201ENST00000418297 528 ntTSL 4 BASIC10.41□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 AC005006.1-201ENST00000432130 249 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 AC016396.1-201ENST00000440189 328 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 AC073188.4-201ENST00000450077 528 ntTSL 4 BASIC10.41□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 AC114755.1-201ENST00000453101 868 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 AC096637.1-201ENST00000458662 174 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 CREM-242ENST00000490511 469 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 AC009509.3-201ENST00000542428 314 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.3 ms