Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 RPL5P5-201ENST00000392009 893 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 SNX24-202ENST00000395451 1050 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 AL022100.2-201ENST00000422548 389 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 RPL5P9-201ENST00000448118 886 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 AC084200.1-201ENST00000547370 547 ntTSL 4 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 AC044860.2-201ENST00000561005 179 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 AC009054.1-201ENST00000568140 427 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 AL583832.1-201ENST00000603227 784 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 AC037198.3-201ENST00000616754 526 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 AF117829.2-201ENST00000619538 361 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 ST6GALNAC3-203ENST00000621530 617 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 AC018445.2-201ENST00000622987 260 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 ASAH1-224ENST00000636269 685 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 METTL9-211ENST00000615720 2890 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 AC092725.2-201ENST00000567658 1389 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 DLG2-203ENST00000376104 5139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 HMGN2P46-204ENST00000409454 1923 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 PPP2R3A-201ENST00000264977 6795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 KANTR-203ENST00000604062 4251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 SPATA31B1P-201ENST00000434692 4016 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 KCNJ1-203ENST00000392664 1674 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 CNKSR3-205ENST00000607772 21063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 KIAA2012-204ENST00000498697 3772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 PRLR-216ENST00000542609 1764 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 DLG2-230ENST00000532653 2891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 DCSTAMP-201ENST00000297581 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 CNTN3-201ENST00000263665 4948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 PRRC2C-202ENST00000367742 10366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 KIF18A-201ENST00000263181 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 AC011416.1-201ENST00000514947 1732 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 KLHL41-201ENST00000284669 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 MYO6-208ENST00000627432 4074 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 ATMIN-204ENST00000564241 4803 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 WBP11P1-201ENST00000562560 1931 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 CNTNAP4-206ENST00000478060 3708 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 TCEANC2-201ENST00000234827 10436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 BPY2-201ENST00000331070 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 BPY2C-201ENST00000382287 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 BPY2B-201ENST00000382392 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 AL023284.3-201ENST00000407767 334 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 FO393401.1-203ENST00000416260 486 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 GNRH1-202ENST00000421054 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 AC139712.3-201ENST00000443926 639 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 AF015262.1-201ENST00000455028 698 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 SIAH1P1-201ENST00000479411 923 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 AC012050.1-201ENST00000558185 472 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 CAPN3-210ENST00000561817 915 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 TPTE2P2-202ENST00000605924 2113 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 Metazoa_SRP.199-201ENST00000615501 281 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 TADA2A-212ENST00000620367 1043 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 C9orf135-AS1-201ENST00000439418 1375 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 SERPINA9-204ENST00000424550 1462 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 AC117409.1-201ENST00000470499 1310 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 BNC2-203ENST00000380672 12844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 DNAJC16-202ENST00000375847 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 LRRC36-205ENST00000563189 2104 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 ABCD3-202ENST00000370214 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 EIF4G2-208ENST00000526148 4001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 TMTC2-204ENST00000549919 6211 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 TEAD1-203ENST00000526600 8477 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 AGO1-202ENST00000373206 3996 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 LINC00624-201ENST00000619867 3088 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 GNL2P1-201ENST00000451274 2190 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 CMAHP-202ENST00000377993 1681 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 AL096711.1-201ENST00000404780 554 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 AP000534.2-201ENST00000412729 568 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 NPM1P4-201ENST00000414095 812 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 AL513329.1-201ENST00000426575 657 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 AC010978.1-202ENST00000427050 893 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 SPRYD7P1-201ENST00000443861 570 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 LAMTOR5-AS1-201ENST00000444238 881 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 AC108693.1-201ENST00000496068 432 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 SSX8-201ENST00000506270 579 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 OR5M14P-201ENST00000506803 618 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 HDAC2-AS2-217ENST00000523087 493 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 MOCS2-208ENST00000527216 707 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms