Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 ATP1A1-203ENST00000369496 3572 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 AL359694.1-201ENST00000403247 604 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 AL589994.1-201ENST00000404962 340 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 AC096644.3-201ENST00000416788 338 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 AC093151.2-201ENST00000429109 394 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 AL645931.1-201ENST00000439737 410 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 SNRPBP1-201ENST00000443634 282 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 GAPDHP20-201ENST00000444107 1007 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
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USP18Q9UMW8 SEPHS1P4-201ENST00000446112 1176 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 RNU7-157P-201ENST00000459600 66 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
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USP18Q9UMW8 SCG5-207ENST00000497208 949 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 SNORA58-201ENST00000505219 137 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 AC083906.1-201ENST00000509298 406 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 SNX18P25-201ENST00000510539 758 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
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USP18Q9UMW8 LECT2-205ENST00000522943 574 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 AP001831.1-201ENST00000524610 411 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 MS4A1-205ENST00000528313 928 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 CCND2-AS2-201ENST00000537370 495 ntTSL 4 BASIC6.95□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 AC063926.1-201ENST00000539532 415 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 KLRK1-204ENST00000540818 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 AC007068.2-201ENST00000543168 395 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 TMEM116-208ENST00000549537 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
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USP18Q9UMW8 AC005632.2-201ENST00000564271 828 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 MIR4502-201ENST00000580432 81 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 MIMT1-201ENST00000597105 1050 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 AC068620.3-201ENST00000602749 560 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
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USP18Q9UMW8 CU634019.4-201ENST00000623347 897 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
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USP18Q9UMW8 AC010325.3-201ENST00000641084 394 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 L3MBTL3-201ENST00000361794 4217 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
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USP18Q9UMW8 PHLDB2-211ENST00000481953 5474 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
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USP18Q9UMW8 LINC00284-201ENST00000423211 3208 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
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USP18Q9UMW8 USP50-203ENST00000532404 1386 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
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USP18Q9UMW8 NIT2-201ENST00000394140 7289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
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USP18Q9UMW8 RAD51B-210ENST00000487270 2596 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
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USP18Q9UMW8 SNORA51.1-201ENST00000363243 140 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 RNA5SP512-201ENST00000364550 120 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 FAIM-204ENST00000393035 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 PRELID1P1-201ENST00000403549 660 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 CCL20-202ENST00000409189 839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 ATF2-205ENST00000409499 801 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 RN7SKP129-201ENST00000410288 299 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 ZEB2-AS1-203ENST00000428623 436 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 AL669831.5-205ENST00000429505 441 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 AC016766.1-201ENST00000429636 714 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
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USP18Q9UMW8 LINC01878-201ENST00000434559 769 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 AC003991.1-210ENST00000434733 1048 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 AL513321.1-201ENST00000441175 761 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
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USP18Q9UMW8 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 RPL7P51-201ENST00000490532 749 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 FO393419.2-201ENST00000492975 428 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 AC098859.2-201ENST00000506232 563 ntTSL 4 BASIC6.94□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 AC005699.1-204ENST00000509244 747 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 ZBED3-AS1-209ENST00000512213 681 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 AC022784.1-201ENST00000512942 699 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 RNA5SP441-201ENST00000516809 88 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
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