Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 LINC01699-201ENST00000319701 259 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
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FOXQ1Q9C009 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
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FOXQ1Q9C009 AC016722.1-201ENST00000453936 652 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
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FOXQ1Q9C009 RPS26P11-201ENST00000463445 348 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 RPL34P34-201ENST00000465389 354 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
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FOXQ1Q9C009 AL138787.2-201ENST00000466576 367 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 RPS26P6-201ENST00000475156 348 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 CPHL1P-204ENST00000482639 584 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 LINC02236-201ENST00000508881 552 ntTSL 4 BASIC7.15□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 AC139713.2-204ENST00000511042 342 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 LINC01060-205ENST00000512839 716 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
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FOXQ1Q9C009 PPP6R3-206ENST00000524904 4292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
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FOXQ1Q9C009 TOGARAM2-201ENST00000379558 12691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 PAIP1-202ENST00000338972 1814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 EYA1-202ENST00000340726 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 CCRL2-201ENST00000357392 1593 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 PPIAP22-201ENST00000358455 498 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 AADACL3-201ENST00000359318 3662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 HIVEP2-202ENST00000367603 9724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 SLAMF6-201ENST00000368055 730 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 ZFX-204ENST00000379188 7513 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 HMGB1P10-201ENST00000395823 563 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 MAGEB16-205ENST00000399992 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 AL359715.1-201ENST00000404330 555 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
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