Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 ING3-204ENST00000431467 1447 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTF1AQ7RTS3 AL627309.5-201ENST00000484859 4860 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTF1AQ7RTS3 ZNF329-203ENST00000597186 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTF1AQ7RTS3 HTR2A-203ENST00000543956 4689 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTF1AQ7RTS3 KIAA0391-201ENST00000250377 6118 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTF1AQ7RTS3 CLCA3P-203ENST00000490028 2781 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PTF1AQ7RTS3 SORBS1-203ENST00000354106 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTF1AQ7RTS3 TAF1-203ENST00000373790 7629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTF1AQ7RTS3 THAP6-201ENST00000311638 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTF1AQ7RTS3 CCDC125-202ENST00000396496 4198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTF1AQ7RTS3 GPN1-203ENST00000424214 1725 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTF1AQ7RTS3 AC079753.1-201ENST00000623243 3868 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PTF1AQ7RTS3 PMFBP1-201ENST00000237353 3527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTF1AQ7RTS3 OR10K2-202ENST00000641042 3023 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTF1AQ7RTS3 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTF1AQ7RTS3 LNPK-212ENST00000544803 7647 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTF1AQ7RTS3 COL21A1-203ENST00000370819 4094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTF1AQ7RTS3 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTF1AQ7RTS3 CIITA-201ENST00000324288 11952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTF1AQ7RTS3 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PTF1AQ7RTS3 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTF1AQ7RTS3 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PTF1AQ7RTS3 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTF1AQ7RTS3 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTF1AQ7RTS3 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PTF1AQ7RTS3 AC114728.1-201ENST00000488289 483 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PTF1AQ7RTS3 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PTF1AQ7RTS3 AC016813.1-201ENST00000521511 735 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTF1AQ7RTS3 AC022075.2-201ENST00000535911 562 ntTSL 4 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTF1AQ7RTS3 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PTF1AQ7RTS3 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTF1AQ7RTS3 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTF1AQ7RTS3 AP005209.1-201ENST00000582531 928 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTF1AQ7RTS3 LINC01476-202ENST00000584262 635 ntTSL 4 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTF1AQ7RTS3 OR7A11P-201ENST00000597719 953 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PTF1AQ7RTS3 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PTF1AQ7RTS3 AC133644.2-201ENST00000608142 540 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PTF1AQ7RTS3 AC024255.1-201ENST00000614376 102 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PTF1AQ7RTS3 THRA1/BTR-204ENST00000621191 513 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTF1AQ7RTS3 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PTF1AQ7RTS3 ADAMTS6-203ENST00000381055 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTF1AQ7RTS3 ROBO1-202ENST00000464233 6742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTF1AQ7RTS3 OR7D4-202ENST00000641244 4968 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTF1AQ7RTS3 AHI1-204ENST00000367800 5921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTF1AQ7RTS3 MAPK1IP1L-201ENST00000395468 6480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTF1AQ7RTS3 MEPE-203ENST00000424957 2022 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTF1AQ7RTS3 TTC7B-201ENST00000328459 19458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTF1AQ7RTS3 YES1P1-201ENST00000418510 1628 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PTF1AQ7RTS3 TCF12-207ENST00000557843 4076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTF1AQ7RTS3 ATP10D-201ENST00000273859 6655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTF1AQ7RTS3 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTF1AQ7RTS3 ARMCX5-202ENST00000372742 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTF1AQ7RTS3 AC001226.2-204ENST00000638101 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTF1AQ7RTS3 CA1-222ENST00000523953 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTF1AQ7RTS3 GPRIN3-201ENST00000333209 6260 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTF1AQ7RTS3 ASAH1-267ENST00000637991 2399 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTF1AQ7RTS3 DNAJC6-201ENST00000263441 5916 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTF1AQ7RTS3 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTF1AQ7RTS3 COX7B2-202ENST00000396533 617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTF1AQ7RTS3 MIR541-201ENST00000401360 84 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PTF1AQ7RTS3 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PTF1AQ7RTS3 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTF1AQ7RTS3 SLC8A1-AS1-202ENST00000417875 344 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTF1AQ7RTS3 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTF1AQ7RTS3 RPL7P61-201ENST00000451721 751 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PTF1AQ7RTS3 AP000472.1-201ENST00000452500 530 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTF1AQ7RTS3 AL355032.1-201ENST00000472981 438 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PTF1AQ7RTS3 AC008629.2-201ENST00000503783 483 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PTF1AQ7RTS3 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PTF1AQ7RTS3 HAUS8P1-201ENST00000549005 542 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PTF1AQ7RTS3 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTF1AQ7RTS3 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTF1AQ7RTS3 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTF1AQ7RTS3 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PTF1AQ7RTS3 LINC00649-203ENST00000427447 9124 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTF1AQ7RTS3 OPALIN-202ENST00000393870 3578 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTF1AQ7RTS3 ATF6-201ENST00000367942 7496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTF1AQ7RTS3 BLOC1S2-205ENST00000614731 2634 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTF1AQ7RTS3 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTF1AQ7RTS3 AL157831.2-201ENST00000564681 3095 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PTF1AQ7RTS3 MAPK10-251ENST00000640858 3052 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTF1AQ7RTS3 DPH5-203ENST00000370109 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTF1AQ7RTS3 HTR1D-201ENST00000374619 2835 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTF1AQ7RTS3 RABGEF1-202ENST00000380828 3864 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTF1AQ7RTS3 CCDC162P-202ENST00000368966 6751 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PTF1AQ7RTS3 RRS1-AS1-201ENST00000499642 4366 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTF1AQ7RTS3 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTF1AQ7RTS3 CPS1-212ENST00000619804 1542 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTF1AQ7RTS3 RAB14-201ENST00000373840 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTF1AQ7RTS3 CASC19-248ENST00000641674 1356 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PTF1AQ7RTS3 DCDC2-201ENST00000378450 3684 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTF1AQ7RTS3 PLEKHH2-201ENST00000282406 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTF1AQ7RTS3 PREPL-203ENST00000378520 2308 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTF1AQ7RTS3 OR2T6-202ENST00000641644 4670 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTF1AQ7RTS3 DLG2-211ENST00000426717 5927 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTF1AQ7RTS3 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTF1AQ7RTS3 AC105114.1-201ENST00000624795 1862 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PTF1AQ7RTS3 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTF1AQ7RTS3 ENTPD1-205ENST00000453258 5044 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTF1AQ7RTS3 TCL6-203ENST00000459662 3307 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
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