Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 MIR3976HG-202ENST00000566533 1690 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 HNRNPU-223ENST00000640001 4227 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 NLRP3P1-201ENST00000622303 1785 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 C1orf100-201ENST00000308105 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 OR2D3-201ENST00000317834 1070 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AHCYP5-201ENST00000331585 1238 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 NOVA1-201ENST00000344429 896 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 SNORA58.1-201ENST00000364133 136 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 TRAV8-2-201ENST00000390434 566 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AL590762.1-201ENST00000391782 432 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 HCG18-234ENST00000413358 916 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 MIATNB-201ENST00000417083 706 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC002454.1-204ENST00000419668 527 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AL109924.2-201ENST00000419800 934 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 LINC00381-201ENST00000423629 727 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC092162.2-203ENST00000430460 579 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC018865.1-201ENST00000433507 578 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC011995.1-201ENST00000437610 578 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC136896.1-201ENST00000438334 547 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 ARMC4P1-201ENST00000438905 707 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC123904.1-201ENST00000441072 368 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AL122008.4-201ENST00000446433 388 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AP002856.1-201ENST00000447864 562 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 FTH1P27-201ENST00000449509 551 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC022498.1-201ENST00000449845 696 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 LINC01825-201ENST00000452381 850 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 LINC00533-201ENST00000456103 537 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AL135902.1-201ENST00000458017 384 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC104619.1-201ENST00000459634 631 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 RN7SL520P-201ENST00000474110 286 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 IAH1-205ENST00000482918 863 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 RN7SL344P-201ENST00000485522 296 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 OR7E99P-201ENST00000505750 922 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 SNRPCP16-201ENST00000506029 210 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 LINC02383-201ENST00000508563 582 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 LINC02217-203ENST00000508677 296 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC093824.1-201ENST00000508796 343 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 STPG2-AS1-201ENST00000508933 537 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 TUBB4BP5-201ENST00000512282 427 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC010634.1-201ENST00000513925 540 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC016885.1-201ENST00000517796 532 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 RPL10P19-201ENST00000519013 301 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC008429.4-201ENST00000521201 182 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 HNRNPA1P38-201ENST00000523612 957 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 OR5M7P-201ENST00000526140 972 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AP000445.1-201ENST00000526692 741 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AP001999.3-201ENST00000529922 455 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC103681.1-201ENST00000531663 423 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AP003031.1-201ENST00000534354 758 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AP000439.1-201ENST00000544004 581 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 TSFM-209ENST00000548851 794 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 TUBBP8-201ENST00000560273 1232 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC099511.1-201ENST00000564561 590 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 TEX46-202ENST00000566855 510 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC009039.1-201ENST00000568711 471 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 PMM2-216ENST00000569958 698 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 PDE6G-202ENST00000571004 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 CLDN6-203ENST00000572154 461 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC141257.3-201ENST00000572906 215 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC024267.4-202ENST00000582631 436 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC026458.2-201ENST00000589323 531 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 ADGRF5P1-202ENST00000590130 980 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 ZNF415-221ENST00000600574 563 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AL158151.4-201ENST00000600965 507 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AL358335.3-201ENST00000604678 327 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC091393.1-201ENST00000605088 598 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC093726.2-201ENST00000609134 679 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC243772.3-202ENST00000609662 1148 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC087633.2-208ENST00000612877 502 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC126755.6-201ENST00000615944 111 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC245505.3-201ENST00000616788 358 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC106875.2-201ENST00000617634 596 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 ALOX5AP-203ENST00000617770 1224 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AP000769.1-201ENST00000619960 844 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.4 ms