Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 STT3A-214ENST00000531491 2160 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 KIAA0232-202ENST00000425103 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 USP40-202ENST00000409945 1946 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 KARSP1-201ENST00000451871 1752 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 AL390726.6-201ENST00000637760 1654 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 PSMC6-218ENST00000606149 1560 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 LRRTM4-205ENST00000409911 2976 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 C12orf4-209ENST00000545746 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 NDUFA4-201ENST00000339600 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 PSMA3-201ENST00000216455 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 CLEC2D-202ENST00000261340 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 RNU1-134P-201ENST00000362935 165 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 RN7SKP77-201ENST00000363261 353 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 PTPN20-208ENST00000395727 790 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 AC104843.2-201ENST00000427666 297 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 HTR5BP-202ENST00000434708 1193 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 AC079922.1-201ENST00000443291 359 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 FTLP8-201ENST00000446770 267 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 AL139350.1-201ENST00000448825 408 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 AL021940.1-201ENST00000454271 677 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 MTATP6P1-201ENST00000514057 681 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 AC090155.1-201ENST00000520800 407 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 AP000763.3-201ENST00000542598 334 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 PPFIA2-219ENST00000550359 3808 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 AC089998.2-201ENST00000551856 277 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 FLVCR2-207ENST00000555027 938 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 AL355075.2-201ENST00000555435 478 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 AC009120.4-201ENST00000564455 513 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 AC007639.1-201ENST00000577281 833 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 AC106037.2-201ENST00000578583 447 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 SETP3-201ENST00000581726 813 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 AC243967.1-201ENST00000598976 578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 AC120349.1-201ENST00000599498 282 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 RAD54B-201ENST00000297592 1879 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 DDX6-208ENST00000620157 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 ZC3H11A-201ENST00000332127 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 MAPK9-213ENST00000539014 1668 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 VNN3-203ENST00000392393 1603 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 CLCC1-205ENST00000369969 4343 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 FOCAD-201ENST00000338382 5765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 CASC19-238ENST00000641523 1558 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 IL23R-201ENST00000347310 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 DGKB-202ENST00000402815 5595 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 QRSL1-202ENST00000369046 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 DMD-202ENST00000343523 5623 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 ALKAL2-201ENST00000344414 449 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 OR2L2-201ENST00000366479 1134 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 AL031985.1-201ENST00000392713 418 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 PIGP-204ENST00000399102 688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 OSBPL10-AS1-202ENST00000418728 458 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 CDY8P-201ENST00000428380 1279 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 CLYBL-AS2-201ENST00000430125 695 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 AC060234.3-201ENST00000430438 559 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 RPL12P16-201ENST00000431098 498 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 CDY20P-201ENST00000447528 1279 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 AF015262.1-201ENST00000455028 698 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 SEMA6A-AS1-202ENST00000508424 862 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 CYP4F27P-201ENST00000514557 494 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 TULP3P1-203ENST00000606237 586 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 AL645933.2-201ENST00000606743 1207 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 MALAT1-214ENST00000618925 424 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 OR5D13-201ENST00000623930 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 GCSAML-210ENST00000536561 4063 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 PDE4B-207ENST00000480109 2037 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 MTAP-210ENST00000580900 7557 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 PSG10P-201ENST00000501199 1500 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 TRIM6-205ENST00000445329 2951 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 SATL1-202ENST00000509231 2224 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 SMC1A-201ENST00000322213 9784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 MEF2C-226ENST00000625674 4343 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 AP2B1-211ENST00000610402 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 CACNA2D3-210ENST00000490478 3557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 RAPH1-204ENST00000418114 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
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