Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 LYSMD3-203ENST00000500869 3863 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 NOVA1-204ENST00000465357 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 GPR63-201ENST00000229955 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 SLFN11-202ENST00000394566 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 PDXK-201ENST00000291565 7366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 GANC-201ENST00000318010 7781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 KLHL3-201ENST00000309755 6806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 TCF4-248ENST00000616053 8140 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 ADAL-201ENST00000389651 1559 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 LECT2-203ENST00000512872 762 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AC005000.1-201ENST00000536192 288 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 CACNA2D3-212ENST00000620722 3296 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 ANKRD52-201ENST00000267116 8688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 TMED2-203ENST00000509052 1975 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 SMAD1-202ENST00000394092 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 NWD1-201ENST00000379808 7254 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 IPO8-209ENST00000544829 3212 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 CFAP61-201ENST00000245957 4082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 APC2-203ENST00000535453 11656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 LACRT-201ENST00000257867 551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AL592293.2-201ENST00000422292 996 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AL713851.1-201ENST00000438753 918 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 TAF1-201ENST00000276072 5692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 ADAMTSL1-205ENST00000380548 8030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 CASC19-228ENST00000641414 1684 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AK4-201ENST00000327299 6836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 LINC01520-201ENST00000441457 1487 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 METTL9-211ENST00000615720 2890 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 ZNF8-201ENST00000621650 9128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AMZ2-206ENST00000577985 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 SLC30A8-201ENST00000427715 5430 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 SERPINB4-201ENST00000341074 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 LINC00342-201ENST00000412393 654 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 SLC9A9-AS2-201ENST00000490153 327 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AC069366.1-201ENST00000583159 838 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AC092683.1-203ENST00000594050 654 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AC020765.1-201ENST00000604296 328 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AC099676.1-201ENST00000608886 657 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 DR1-202ENST00000370272 10148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 ZNF235-201ENST00000291182 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 PPFIA2-203ENST00000443686 3782 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 ZNF566-202ENST00000424129 2644 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AC062029.1-202ENST00000606164 3651 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 ATG13-203ENST00000524625 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 TCF4-225ENST00000564999 3590 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 PBRM1-208ENST00000410007 4905 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 OR2T33-202ENST00000641220 4118 ntAPPRIS P1 BASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AC011455.2-201ENST00000599320 3336 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 ATP7B-201ENST00000242839 6638 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 ZNF317-202ENST00000360385 3955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 SVBP-202ENST00000372522 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 TEX50-201ENST00000417563 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
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HERC1Q15751 Metazoa_SRP.134-201ENST00000610965 327 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 NUFIP1-201ENST00000379161 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 OAS2-202ENST00000392583 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 ITGB6-201ENST00000283249 4675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 DGKB-206ENST00000407950 3651 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 HABP2-201ENST00000351270 3009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 ATP8B1-201ENST00000283684 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 KPNA1-201ENST00000344337 6830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 CTNNA1P1-201ENST00000515849 2728 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 ICOSLG-204ENST00000407780 7080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 NTRK3-212ENST00000558676 4670 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 FAM13A-202ENST00000395002 4945 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 LINC02203-204ENST00000628444 2323 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 RPL24P7-201ENST00000399435 453 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AC096754.1-201ENST00000508904 818 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AC120057.5-201ENST00000623840 154 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
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