Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 AHNAK2-201ENST00000333244 18254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 ANGPT1-205ENST00000520052 1523 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 KLHL41-201ENST00000284669 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 OR2H1-201ENST00000377132 2253 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 GRIA3-207ENST00000620443 4943 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 CLEC12B-202ENST00000396502 3029 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 LINC01504-201ENST00000436054 2078 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 RASSF8-213ENST00000542865 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 OR2AG1-202ENST00000641258 6993 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 LINC01684-203ENST00000453784 2908 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 AL391704.1-201ENST00000422206 2368 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 PSMA3-201ENST00000216455 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 OR1D2-201ENST00000331459 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 ODF3-202ENST00000342593 386 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 TRAV1-2-201ENST00000390423 402 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 SNX24-202ENST00000395451 1050 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 RPA3-204ENST00000406109 434 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 MIR1275-201ENST00000408770 80 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 LINC01638-201ENST00000418271 552 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 AL353662.1-201ENST00000439099 327 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 SNORA81.2-201ENST00000516868 170 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 FAU-203ENST00000525297 355 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 AP003080.1-202ENST00000526526 915 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 AC069208.1-201ENST00000540811 676 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 AC089998.2-201ENST00000551856 277 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 AC010401.2-202ENST00000570663 396 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 AC068768.2-201ENST00000602352 343 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 AL136097.3-201ENST00000611097 505 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 MALAT1-214ENST00000618925 424 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 MIR6806-201ENST00000622141 64 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 AC073488.3-201ENST00000631611 778 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 PUS10-201ENST00000316752 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 ABCB11-201ENST00000263817 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 AP002478.1-201ENST00000577848 1455 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 CYLD-207ENST00000564326 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 AC087258.1-203ENST00000545400 1629 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 ACOD1-202ENST00000449753 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 C1orf162-201ENST00000343534 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 AL096800.1-201ENST00000405326 893 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 LINC01114-201ENST00000421071 482 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 PLA2G12AP2-201ENST00000424744 264 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 FRMPD4-AS1-201ENST00000425057 285 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 AL008723.2-201ENST00000426354 562 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 AL365220.1-201ENST00000432923 399 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 AL390879.1-201ENST00000439143 386 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 CUBNP2-201ENST00000443534 1139 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 AL590399.3-202ENST00000448491 495 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 HRAT17-202ENST00000451962 687 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 AC118758.1-202ENST00000454719 225 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 AC122718.2-201ENST00000505325 591 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 PRMT5P1-201ENST00000514351 598 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 AP002370.2-201ENST00000531424 545 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 KLRC1-204ENST00000536188 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 AL133240.1-201ENST00000553537 580 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 AL845552.1-201ENST00000556820 323 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 AC010325.1-202ENST00000562076 279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms