Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 HGF-205ENST00000423064 1990 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 G6PC-201ENST00000253801 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 AC006455.6-201ENST00000426192 893 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 FABP5P2-201ENST00000439042 408 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 AL359513.1-201ENST00000614364 557 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 KLHL5-205ENST00000508137 2926 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 CDKAL1-204ENST00000613575 1673 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 EPHA3-201ENST00000336596 5809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 NCR3LG1-201ENST00000338965 6438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 CNTNAP4-209ENST00000622250 3783 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 BLOC1S2-205ENST00000614731 2634 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 FBXW2-205ENST00000608872 9138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 AC073429.2-201ENST00000569694 1444 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 LINC01616-201ENST00000561816 2280 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 AC103563.5-201ENST00000455643 364 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 LINC01448-201ENST00000455947 1171 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 AC105420.1-201ENST00000504389 582 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 LINC02505-202ENST00000510597 776 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 RN7SKP98-201ENST00000517070 156 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 YWHAZ-220ENST00000522819 875 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 AP001893.1-201ENST00000532866 362 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 LINC01708-202ENST00000634316 859 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 ZHX3-201ENST00000309060 10030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 CYP27C1-201ENST00000335247 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 TCF7L2-210ENST00000369397 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 ZNF229-204ENST00000614049 4507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 OR1M1-202ENST00000641627 2535 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 CLASP2-225ENST00000635664 4176 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 MCFD2-202ENST00000409105 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 ZNF24-204ENST00000589881 7419 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 NAA25-201ENST00000261745 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 TNPO1P1-201ENST00000423641 1138 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 AL022331.1-201ENST00000429025 477 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 LINC01609-202ENST00000522778 566 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 AC106730.2-201ENST00000566641 540 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 AC091151.1-201ENST00000587369 726 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 AC025278.1-201ENST00000593558 515 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 CYCSP1-201ENST00000604815 315 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 MIR7155-201ENST00000615925 56 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 LINC01320-210ENST00000626008 929 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 VTCN1-202ENST00000359008 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 ALKBH8-205ENST00000428149 4079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 CEP120-202ENST00000306481 4629 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 RUNDC3A-AS1-202ENST00000588097 5203 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 PDE4B-207ENST00000480109 2037 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 VTI1A-201ENST00000393077 4131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 IFNE-201ENST00000448696 1475 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 CNTN5-202ENST00000418526 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 AL512328.1-202ENST00000452640 850 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 LINC01780-202ENST00000457683 391 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 AP001496.3-201ENST00000580230 913 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 Metazoa_SRP.170-201ENST00000616060 254 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 AC087269.2-201ENST00000641764 975 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 PNPLA4-204ENST00000537427 2559 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 FBXW7-203ENST00000296555 3572 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 OR7D2-203ENST00000642043 3157 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 ETV1-210ENST00000430479 6740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 FAM135B-204ENST00000395297 6962 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 ERLIN2-201ENST00000276461 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 YES1P1-201ENST00000418510 1628 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 EBLN2-201ENST00000533473 1679 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
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