Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 BDNF-207ENST00000395986 3979 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 RIPK1-202ENST00000380409 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 PBRM1-202ENST00000337303 4825 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 AC096669.1-202ENST00000413708 616 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 AC022173.1-201ENST00000418554 577 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 AC108066.1-201ENST00000437261 596 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 LINC01013-203ENST00000443303 569 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 GAPDHP23-201ENST00000444823 993 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 AP000472.1-201ENST00000452500 530 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 HIGD1AP8-201ENST00000453927 274 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 SNORA58-201ENST00000505219 137 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 AC091965.3-201ENST00000506236 208 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 LINC02424-201ENST00000548512 1264 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 AC012050.1-201ENST00000558185 472 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 AC006504.7-201ENST00000592806 924 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 AC022919.1-201ENST00000624979 626 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 PFKM-232ENST00000629846 381 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 NAALAD2-201ENST00000321955 3035 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 IRF6-201ENST00000367021 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 PRLR-208ENST00000509140 1610 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 MITF-201ENST00000314557 1798 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 AC099753.1-201ENST00000634947 2118 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 BDNF-217ENST00000533131 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 RNA5SP333-201ENST00000363466 118 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 RNA5SP334-201ENST00000364825 118 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 RN7SL870P-201ENST00000460111 296 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 AC023906.4-201ENST00000557898 895 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 AC103876.1-202ENST00000561498 369 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 AC040977.1-201ENST00000573222 343 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 AC087763.1-201ENST00000603391 286 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 RNF217-AS1-201ENST00000439075 4507 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 HSD17B4-212ENST00000509514 2314 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 AL359195.2-201ENST00000623657 4412 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 VTCN1-207ENST00000539893 2719 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 ZIM3-201ENST00000269834 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 KCNJ1-203ENST00000392664 1674 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 XIAP-205ENST00000434753 8415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 OR51E1-201ENST00000396952 3612 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 GNL2P1-201ENST00000451274 2190 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 INTS6-202ENST00000398119 7041 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 CLCN5-204ENST00000376108 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 ZNF121-202ENST00000586602 7177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 NBPF25P-202ENST00000619932 3827 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ACACAQ13085 HYAL4-202ENST00000476325 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 MIR1204-201ENST00000408388 67 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 LINC01798-204ENST00000433396 682 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 RPL7AP6-201ENST00000477943 801 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 LINC02234-202ENST00000513288 705 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 TCF4-225ENST00000564999 3590 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 TMEM75-201ENST00000624314 2165 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 CD46-203ENST00000354848 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 ERVV-1-201ENST00000602168 2202 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 GJC1-202ENST00000426548 7640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 CHURC1-208ENST00000607599 3615 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 ZNF836-201ENST00000322146 2811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 OLMALINC-203ENST00000641087 3779 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 ACOD1-202ENST00000449753 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 GAPDHP24-201ENST00000328713 983 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 AC244394.2-201ENST00000425109 735 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 LINC02257-202ENST00000433576 720 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 ZRANB2-AS1-202ENST00000450461 553 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 AL512328.1-202ENST00000452640 850 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 AC008601.1-201ENST00000519892 527 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 AC008115.4-201ENST00000619780 775 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 AL357562.1-201ENST00000624911 609 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 LAMTOR5-AS1-233ENST00000625451 470 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 SUN3-203ENST00000412142 1448 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ACACAQ13085 FBXL13-201ENST00000313221 2744 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
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