Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TTPAP49638 AC016747.4-201ENST00000462959 1383 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TTPAP49638 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TTPAP49638 RNA5SP110-201ENST00000362638 115 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TTPAP49638 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TTPAP49638 AK3P5-201ENST00000432033 519 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TTPAP49638 RPL5P7-201ENST00000444235 813 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TTPAP49638 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TTPAP49638 AC112495.1-201ENST00000456037 756 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TTPAP49638 SNHG12-207ENST00000475441 444 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TTPAP49638 RPL9P15-201ENST00000491096 532 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TTPAP49638 H2AFV-208ENST00000521529 439 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TTPAP49638 LINC02420-201ENST00000543387 741 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TTPAP49638 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TTPAP49638 AL355838.1-201ENST00000554814 559 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TTPAP49638 AC007346.1-201ENST00000569208 867 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TTPAP49638 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TTPAP49638 AC010401.2-202ENST00000570663 396 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TTPAP49638 SEPT4-AS1-202ENST00000580589 653 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TTPAP49638 AC012370.2-201ENST00000597541 1080 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TTPAP49638 Z99755.2-201ENST00000610215 364 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TTPAP49638 AL589745.2-201ENST00000616366 555 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TTPAP49638 MIR6721-201ENST00000617181 87 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TTPAP49638 OR2AK2-202ENST00000641852 1008 ntAPPRIS P2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TTPAP49638 CASC19-274ENST00000642018 970 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TTPAP49638 LINC00630-201ENST00000416381 2012 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TTPAP49638 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TTPAP49638 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TTPAP49638 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TTPAP49638 UGDH-205ENST00000506179 3021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TTPAP49638 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
TTPAP49638 AC119674.1-202ENST00000641333 1860 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TTPAP49638 AP000547.3-204ENST00000588548 2523 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TTPAP49638 PUS3-203ENST00000530811 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
TTPAP49638 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TTPAP49638 ELAVL4-202ENST00000371819 2467 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TTPAP49638 RBMY1HP-201ENST00000382759 1389 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TTPAP49638 SLC2A14-221ENST00000616981 3366 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TTPAP49638 PSMA3-201ENST00000216455 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
TTPAP49638 GNG5P2-201ENST00000372054 207 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TTPAP49638 IFNB1-201ENST00000380232 859 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TTPAP49638 AC117402.1-202ENST00000383686 820 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TTPAP49638 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TTPAP49638 RPA3-204ENST00000406109 434 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TTPAP49638 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TTPAP49638 AC245884.2-201ENST00000426257 404 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TTPAP49638 TIMM8BP2-201ENST00000445940 251 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TTPAP49638 HNRNPDLP2-201ENST00000455248 751 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TTPAP49638 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TTPAP49638 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TTPAP49638 GCSAM-204ENST00000484193 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TTPAP49638 OR7E99P-201ENST00000505750 922 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TTPAP49638 AC091874.2-201ENST00000505889 720 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TTPAP49638 ZFPM2-AS1-201ENST00000509144 542 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TTPAP49638 AC008957.1-202ENST00000512329 681 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TTPAP49638 PRMT5P1-201ENST00000514351 598 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TTPAP49638 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TTPAP49638 A2MP1-201ENST00000543404 1201 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TTPAP49638 AC087477.5-202ENST00000560242 389 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TTPAP49638 AC092332.1-201ENST00000563684 829 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TTPAP49638 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TTPAP49638 AC239809.3-208ENST00000611452 531 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TTPAP49638 AL357562.1-201ENST00000624911 609 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TTPAP49638 AC111152.1-202ENST00000635848 339 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TTPAP49638 ENTPD1-AS1-212ENST00000458228 3274 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
TTPAP49638 PPIL1-201ENST00000373699 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
TTPAP49638 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TTPAP49638 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TTPAP49638 HSPD1P9-201ENST00000420325 1636 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TTPAP49638 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
TTPAP49638 TRAPPC2-203ENST00000380579 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
TTPAP49638 OR52N5-202ENST00000641181 2778 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TTPAP49638 AP004243.1-201ENST00000529108 1433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TTPAP49638 IFRD1-216ENST00000535603 3397 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TTPAP49638 TAF12-202ENST00000373824 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
TTPAP49638 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TTPAP49638 AC005480.1-202ENST00000555916 3548 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
TTPAP49638 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TTPAP49638 RSU1P2-203ENST00000448600 1582 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
TTPAP49638 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
TTPAP49638 GDNF-AS1-202ENST00000510986 1941 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
TTPAP49638 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TTPAP49638 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TTPAP49638 RBM22-202ENST00000447771 1386 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TTPAP49638 AC104662.2-201ENST00000512921 1388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TTPAP49638 RASSF8-213ENST00000542865 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TTPAP49638 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
TTPAP49638 C3orf14-201ENST00000232519 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TTPAP49638 RNA5SP279-201ENST00000365513 117 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TTPAP49638 RBMS3-AS2-201ENST00000366321 582 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TTPAP49638 TRAV1-2-201ENST00000390423 402 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TTPAP49638 AL512622.1-201ENST00000414106 481 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TTPAP49638 AL137071.1-201ENST00000422150 243 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TTPAP49638 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TTPAP49638 AC117944.1-201ENST00000430748 641 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TTPAP49638 AL160004.1-201ENST00000434311 478 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TTPAP49638 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TTPAP49638 AC097463.1-201ENST00000447288 481 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TTPAP49638 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TTPAP49638 AC092865.4-201ENST00000477936 615 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.1 ms