Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 SLC9A6-213ENST00000637234 4691 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PTPREP23469 KIF23-202ENST00000352331 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PTPREP23469 OXCT1-206ENST00000512084 1593 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PTPREP23469 DIO2-201ENST00000422005 6272 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PTPREP23469 ALDOB-201ENST00000374855 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PTPREP23469 CPEB1-AS1-202ENST00000618020 2994 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
PTPREP23469 TBCK-201ENST00000273980 8101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PTPREP23469 MRPS18C-201ENST00000295491 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PTPREP23469 PRLR-208ENST00000509140 1610 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PTPREP23469 WBP2NL-201ENST00000328823 2255 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PTPREP23469 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
PTPREP23469 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
PTPREP23469 TRGV3-201ENST00000390346 537 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PTPREP23469 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
PTPREP23469 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PTPREP23469 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
PTPREP23469 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
PTPREP23469 AC034195.1-201ENST00000420000 559 ntTSL 4 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PTPREP23469 LINC00851-201ENST00000423033 727 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PTPREP23469 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
PTPREP23469 AL158214.1-201ENST00000444423 404 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
PTPREP23469 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PTPREP23469 AL451074.1-202ENST00000453762 989 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
PTPREP23469 RN7SL282P-201ENST00000479676 297 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
PTPREP23469 RPL7AP26-201ENST00000488538 813 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
PTPREP23469 CSF2RA-217ENST00000494969 489 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PTPREP23469 RN7SL124P-201ENST00000498656 285 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
PTPREP23469 AC010181.1-202ENST00000509191 798 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PTPREP23469 AC012560.1-203ENST00000510550 595 ntTSL 4 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PTPREP23469 AC100849.1-202ENST00000517949 562 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PTPREP23469 AC090568.2-203ENST00000521433 579 ntTSL 4 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PTPREP23469 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PTPREP23469 AC069360.1-202ENST00000533941 557 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PTPREP23469 TMEM132D-AS1-207ENST00000542535 442 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PTPREP23469 AC005833.3-202ENST00000544741 770 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PTPREP23469 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
PTPREP23469 AC011611.6-201ENST00000547483 255 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
PTPREP23469 HIGD1AP9-201ENST00000550710 279 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
PTPREP23469 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PTPREP23469 AC009779.4-201ENST00000554248 611 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
PTPREP23469 AC004825.1-201ENST00000555068 586 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
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PTPREP23469 AC025278.1-201ENST00000593558 515 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PTPREP23469 AL137190.1-201ENST00000603288 282 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
PTPREP23469 MIR6745-201ENST00000612694 127 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
PTPREP23469 AC073862.4-201ENST00000622982 854 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
PTPREP23469 CD46-208ENST00000367042 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PTPREP23469 DCAF6-202ENST00000367840 3349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PTPREP23469 AC004148.2-201ENST00000575890 1938 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PTPREP23469 RAB3IP-215ENST00000551641 2840 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PTPREP23469 OR2A1-202ENST00000641044 4632 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PTPREP23469 DPY19L1P1-201ENST00000417811 2594 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
PTPREP23469 COL24A1-201ENST00000370571 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PTPREP23469 KLHL8-208ENST00000512111 3245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PTPREP23469 ZNF445-202ENST00000425708 10052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PTPREP23469 PPFIA2-220ENST00000550584 5405 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PTPREP23469 FAM217B-201ENST00000358293 5152 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PTPREP23469 GDNF-208ENST00000620847 3638 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PTPREP23469 AC020549.1-201ENST00000536916 1440 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
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PTPREP23469 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
PTPREP23469 DRP2-205ENST00000541709 6835 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PTPREP23469 AC073525.1-203ENST00000547040 2631 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PTPREP23469 PICALM-201ENST00000356360 1958 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PTPREP23469 ZNF613-201ENST00000293471 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PTPREP23469 MAGT1-205ENST00000618282 2788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PTPREP23469 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PTPREP23469 DHX35-201ENST00000252011 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
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PTPREP23469 CSMD1-216ENST00000602557 11740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.92
PTPREP23469 WISP3-204ENST00000368666 2700 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
PTPREP23469 BBS12-203ENST00000542236 3431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.92
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PTPREP23469 OR6N1-203ENST00000641846 2640 ntAPPRIS P1 BASIC9.27□□□□□ -0.93
PTPREP23469 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
PTPREP23469 FAM120B-203ENST00000537664 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
PTPREP23469 IMPA1-202ENST00000311489 1106 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
PTPREP23469 SNORA30B-201ENST00000365319 129 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
PTPREP23469 THEM5-201ENST00000368817 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PTPREP23469 C1orf54-203ENST00000369102 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
PTPREP23469 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
PTPREP23469 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
PTPREP23469 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
PTPREP23469 MIR106B-201ENST00000385301 82 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
PTPREP23469 TRBV5-3-201ENST00000390362 343 ntAPPRIS P1 BASIC9.27□□□□□ -0.93
PTPREP23469 RNA5SP18-201ENST00000390935 121 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
PTPREP23469 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PTPREP23469 BRD8-203ENST00000402931 2982 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
PTPREP23469 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
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PTPREP23469 AL357315.1-201ENST00000422930 254 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
PTPREP23469 AL445524.1-205ENST00000425412 392 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
PTPREP23469 MIR181A1HG-202ENST00000432296 930 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
PTPREP23469 MIR4422HG-201ENST00000451250 638 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
PTPREP23469 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
PTPREP23469 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
PTPREP23469 AC115223.1-201ENST00000466377 870 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
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