Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 PCDH19-203ENST00000420881 7936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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COL24A1Q17RW2 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
COL24A1Q17RW2 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
COL24A1Q17RW2 IL31RA-202ENST00000354961 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
COL24A1Q17RW2 NPHP1-203ENST00000393272 2752 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
COL24A1Q17RW2 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
COL24A1Q17RW2 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
COL24A1Q17RW2 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
COL24A1Q17RW2 NEMP2-202ENST00000409150 6168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
COL24A1Q17RW2 ADAM20P1-202ENST00000556964 3034 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
COL24A1Q17RW2 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
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