Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 HNRNPU-223ENST00000640001 4227 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 TCL6-203ENST00000459662 3307 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 SLC9A4-201ENST00000295269 4138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 ARMCX5-206ENST00000604957 4640 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 CACNA1E-203ENST00000360108 6970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 SORBS2-201ENST00000284776 5996 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 RNF41-212ENST00000615206 5216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 NPIPB6-201ENST00000532254 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 LINC00700-201ENST00000413603 2097 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 PRPF40A-202ENST00000410080 8048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 RPS7P8-201ENST00000418311 581 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 ARPP21-218ENST00000438071 1103 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AL136455.1-201ENST00000441083 1240 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 RSRC1-207ENST00000475278 1195 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 CYFIP2-209ENST00000521420 6370 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC087379.1-201ENST00000524613 993 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 UBE2FP2-201ENST00000566646 462 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 WBP1LP8-201ENST00000617401 327 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AGPAT4-203ENST00000366911 7705 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 TTLL4-201ENST00000258398 4730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 KIAA1614-202ENST00000367588 9654 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC008560.1-201ENST00000510585 1766 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 PAX6-270ENST00000640368 6975 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 CYP19A1-202ENST00000396404 2388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AKAP2-202ENST00000374525 6866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 HLF-210ENST00000575345 3589 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 ODF2L-203ENST00000359242 7560 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 TRAF5-202ENST00000336184 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 FAM66C-201ENST00000372173 678 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AL354896.1-201ENST00000430214 561 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 RPL7P32-201ENST00000457119 744 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC016550.3-201ENST00000515706 767 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 INTS9-AS1-201ENST00000520055 548 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 PDE4B-206ENST00000423207 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 SH3BP2-203ENST00000442312 9211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 RAB14-201ENST00000373840 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 MIPOL1-202ENST00000396294 6258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 VPS41-202ENST00000310301 5903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AHCTF1-202ENST00000366508 8751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 BIVM-ERCC5-204ENST00000639132 5195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 ST13P16-201ENST00000401760 781 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AC069234.2-201ENST00000541383 575 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AC026951.2-201ENST00000613847 241 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AC002384.2-201ENST00000636036 790 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 CORIN-202ENST00000502252 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 CNTN4-AS1-201ENST00000442749 1640 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 ZNF493-201ENST00000339914 1665 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 TMEFF2-203ENST00000409056 3364 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 BBOX1-201ENST00000263182 1886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 COL4A6-208ENST00000538570 6528 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 POLR1B-203ENST00000409894 4457 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 SETD5-203ENST00000402198 6827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 ABCB1-210ENST00000543898 4524 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 LMCD1-AS1-202ENST00000439407 576 ntTSL 4 BASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 DEFA11P-201ENST00000446470 261 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 LINC01014-203ENST00000455307 548 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 RANP2-201ENST00000456833 229 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 UTY-212ENST00000545955 6817 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AC145207.6-201ENST00000579981 782 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 ERVW-1-202ENST00000603053 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 ZNF831-203ENST00000637017 10953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
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