Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SS18Q15532 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SS18Q15532 RACGAP1-203ENST00000454520 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SS18Q15532 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SS18Q15532 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SS18Q15532 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SS18Q15532 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SS18Q15532 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SS18Q15532 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SS18Q15532 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SS18Q15532 ATP13A4-204ENST00000400270 1458 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SS18Q15532 ANTXR2-204ENST00000404191 1469 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SS18Q15532 DCSTAMP-208ENST00000622554 1471 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SS18Q15532 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SS18Q15532 AC008080.4-201ENST00000420185 1589 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SS18Q15532 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SS18Q15532 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SS18Q15532 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SS18Q15532 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SS18Q15532 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SS18Q15532 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SS18Q15532 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SS18Q15532 AL136984.1-201ENST00000607611 1893 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SS18Q15532 ZNF675-201ENST00000359788 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SS18Q15532 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SS18Q15532 INTS12-211ENST00000618810 1502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SS18Q15532 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SS18Q15532 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SS18Q15532 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SS18Q15532 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SS18Q15532 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SS18Q15532 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SS18Q15532 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SS18Q15532 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SS18Q15532 OR8A1-201ENST00000284287 1146 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SS18Q15532 ALKAL2-201ENST00000344414 449 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SS18Q15532 SPP1-202ENST00000360804 1196 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SS18Q15532 RNA5SP308-201ENST00000362532 115 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SS18Q15532 RNU1-5P-201ENST00000362684 144 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SS18Q15532 RNA5SP485-201ENST00000365053 119 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SS18Q15532 ATP5EP2-201ENST00000381026 385 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SS18Q15532 EEF1AKMT1-201ENST00000382754 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
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SS18Q15532 AL353133.1-201ENST00000407695 401 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SS18Q15532 AC114498.1-201ENST00000423796 607 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SS18Q15532 AC083862.1-201ENST00000427378 1242 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SS18Q15532 IGLV3-4-201ENST00000432300 244 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SS18Q15532 AL035701.1-202ENST00000437249 371 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
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SS18Q15532 AC100823.1-201ENST00000442274 480 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
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SS18Q15532 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SS18Q15532 AC087565.2-201ENST00000637695 952 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SS18Q15532 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
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SS18Q15532 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SS18Q15532 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SS18Q15532 ALMS1-IT1-201ENST00000441587 2107 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SS18Q15532 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SS18Q15532 ZNF138-206ENST00000440598 2230 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SS18Q15532 METTL9-211ENST00000615720 2890 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SS18Q15532 C14orf105-201ENST00000216445 3082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SS18Q15532 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SS18Q15532 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SS18Q15532 TAF12-202ENST00000373824 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
SS18Q15532 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.73
SS18Q15532 LYPD6B-202ENST00000409029 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
SS18Q15532 LZIC-203ENST00000400903 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
SS18Q15532 ELAVL4-202ENST00000371819 2467 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.73
SS18Q15532 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
SS18Q15532 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
SS18Q15532 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.73
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