Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 AL355838.1-201ENST00000554814 559 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 AC092332.1-201ENST00000563684 829 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 AL645933.2-201ENST00000606743 1207 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 AC092681.3-201ENST00000609463 678 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 RFPL4AP6-201ENST00000616792 846 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 MIR6806-201ENST00000622141 64 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 AP001052.1-201ENST00000626421 99 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 ZNF214-204ENST00000536068 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 KCNQ3-205ENST00000621976 10659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 AL357568.1-201ENST00000421530 1963 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 PTPN3-202ENST00000374541 6703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 PPP1R1C-201ENST00000280295 1636 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 OR1L4-201ENST00000259466 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 RNA5SP232-201ENST00000364144 119 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 RNA5SP279-201ENST00000365513 117 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 IFNB1-201ENST00000380232 859 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 AL137071.1-201ENST00000422150 243 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 CCNB1IP1P1-201ENST00000428976 839 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 AL109807.1-201ENST00000438222 569 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 AL390879.1-201ENST00000439143 386 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 AC092168.1-201ENST00000443030 236 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 MTCO3P17-201ENST00000443775 513 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 BCAP29-207ENST00000445771 1157 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 EEF1B2P3-201ENST00000447718 678 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 AC068491.1-201ENST00000449539 1241 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 WDR11-AS1-201ENST00000451706 1108 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 AL356309.2-201ENST00000454034 719 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 AL445687.2-201ENST00000458156 728 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 SERF1B-203ENST00000503931 569 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 SERF1A-204ENST00000504458 569 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 THAP6-212ENST00000508105 1103 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 HSD3BP3-201ENST00000514706 994 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 AC090572.3-201ENST00000519041 804 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 AP005436.1-201ENST00000531454 488 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 GMDS-AS1-212ENST00000534160 720 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 AC007346.1-201ENST00000569208 867 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 AC010401.2-202ENST00000570663 396 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 LINC01198-204ENST00000594153 552 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 AL596218.1-201ENST00000634239 1140 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 NDST4-204ENST00000613194 3439 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 RSU1P2-203ENST00000448600 1582 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 PSMC6-218ENST00000606149 1560 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 AC016747.4-201ENST00000462959 1383 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 CLEC12B-202ENST00000396502 3029 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 ETF1-203ENST00000503014 1736 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 RAPH1-204ENST00000418114 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 MTCO1P28-201ENST00000574177 1528 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 PSMA3-201ENST00000216455 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 OR51J1-201ENST00000332043 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 ODF3-202ENST00000342593 386 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 RNA5SP110-201ENST00000362638 115 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 TPT1-204ENST00000379060 764 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 AL354893.1-201ENST00000433735 348 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 FTLP8-201ENST00000446770 267 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 AC118758.1-202ENST00000454719 225 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 AC009963.3-201ENST00000458090 486 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 AC092865.4-201ENST00000477936 615 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 AC021006.1-201ENST00000489849 553 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 AC124893.1-201ENST00000496247 545 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 MTCO3P42-201ENST00000509488 518 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 AC008957.1-202ENST00000512329 681 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 MTCO3P39-201ENST00000514812 518 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 FAU-203ENST00000525297 355 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 AP001893.1-201ENST00000532866 362 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 AC090502.3-201ENST00000552046 529 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 AC116158.2-201ENST00000559544 553 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 AC026826.3-201ENST00000561747 158 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 AC145285.4-201ENST00000568183 540 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 AC087392.1-201ENST00000576252 820 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 MIR4502-201ENST00000580432 81 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 GLYATL1P2-202ENST00000588046 902 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
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