Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 HPRT1P1-201ENST00000509498 657 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 AC087855.1-201ENST00000518178 430 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 OR7E128P-201ENST00000532736 1024 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 GCSHP4-201ENST00000538792 439 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 ULK4P1-202ENST00000565174 503 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 AC009167.1-201ENST00000568317 579 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 AC136443.4-201ENST00000568759 579 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 NUDT7-206ENST00000568787 678 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 RPL29P33-201ENST00000587474 316 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 AC005546.1-201ENST00000591837 391 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 UBA2-208ENST00000592791 910 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 CT45A1-201ENST00000594117 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 VN1R81P-201ENST00000602085 372 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 AC111186.1-201ENST00000604684 130 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 BPIFA4P-204ENST00000605211 656 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 AC092106.3-201ENST00000611308 722 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 AC007786.3-201ENST00000615154 596 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 Metazoa_SRP.81-201ENST00000618466 316 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 AC068213.1-201ENST00000625124 226 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 SNORA16A-202ENST00000628458 135 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 GCNT2-218ENST00000640968 939 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 ZNF652-201ENST00000362063 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 LINC02197-201ENST00000502659 2767 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 RBM41-202ENST00000372487 2579 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 DDX60-201ENST00000393743 6071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 GUCY1B2-203ENST00000493639 2871 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 AP002001.1-202ENST00000525797 1754 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 LINC01720-201ENST00000413356 2216 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 ARHGAP42P4-201ENST00000549782 2934 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 AC007491.1-202ENST00000637961 1576 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 OR7D2-203ENST00000642043 3157 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 PGAP1-201ENST00000354764 11114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 AL355306.2-202ENST00000634380 2281 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 APOL4-212ENST00000616056 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 CASC19-255ENST00000641733 1385 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 KLHL7-203ENST00000409689 3231 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 PRIM2-207ENST00000615550 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 NR3C1-205ENST00000415690 3789 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 C5orf24-201ENST00000338051 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 RABGAP1L-206ENST00000367688 1425 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 GDF9-202ENST00000378673 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 AL451064.2-201ENST00000623514 1654 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 ZNF292-202ENST00000369577 10610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 AC007938.1-201ENST00000562524 2902 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 STAU2-210ENST00000521210 1950 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 LCP1-201ENST00000323076 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 DDX43P1-201ENST00000510713 1763 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 TMX2-202ENST00000378312 1521 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 RNU5B-4P-201ENST00000363508 111 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 C1orf194-202ENST00000369945 534 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 AC234772.1-201ENST00000377927 937 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 HMGB3P19-201ENST00000403971 560 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 SNORA79B-201ENST00000410557 148 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 AC009965.1-201ENST00000411436 570 ntTSL 4 BASIC7.19□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 AC096537.2-201ENST00000413707 714 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 RPL7AP51-201ENST00000422016 760 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 HNRNPA1P30-201ENST00000424329 751 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 CLYBL-AS2-201ENST00000430125 695 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 AL365396.1-201ENST00000430854 671 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 AC009299.3-203ENST00000435692 1096 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 C21orf91-OT1-203ENST00000439392 497 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 AC003685.1-201ENST00000440430 466 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 OSBPL10-AS1-206ENST00000447181 575 ntTSL 4 BASIC7.19□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 AC073387.1-201ENST00000453261 709 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 AC008379.1-201ENST00000463655 464 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 RPS14P8-201ENST00000478778 369 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 AC131233.1-201ENST00000479200 955 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 NPM1P29-201ENST00000483112 803 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 CT45A5-201ENST00000487941 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 LINC02049-201ENST00000490647 747 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 RPS10P20-201ENST00000494130 463 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 RN7SL187P-201ENST00000495587 303 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 OR5H3P-201ENST00000502817 919 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 AC103718.1-201ENST00000522667 683 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 SNRPCP6-201ENST00000528310 210 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 AC022182.1-202ENST00000529234 580 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 MIR9-3HG-211ENST00000561037 779 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 AC138811.2-201ENST00000567078 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 MDFIC2-201ENST00000567252 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 LINC01028-201ENST00000586373 1045 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 AL353593.3-201ENST00000602778 764 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 AC067838.1-201ENST00000606064 577 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 AL008582.1-201ENST00000609612 442 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 PFKM-232ENST00000629846 381 ntTSL 4 BASIC7.19□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 ATM-229ENST00000639953 587 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
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