Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 AC118758.1-202ENST00000454719 225 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 AC112187.1-201ENST00000455837 479 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 AC021006.1-201ENST00000489849 553 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 AC021269.1-201ENST00000526860 705 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 LINC01580-202ENST00000555364 661 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 AC090651.1-201ENST00000567865 634 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 MRPS21P8-201ENST00000569196 235 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 AC106037.2-201ENST00000578583 447 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 LINC01999-201ENST00000592917 646 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 CT45A1-201ENST00000594117 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 AC125494.2-201ENST00000602431 657 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 AC009237.12-201ENST00000604755 742 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 AC092681.3-201ENST00000609463 678 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 AC015574.1-205ENST00000611285 524 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 FAM27E2-201ENST00000619668 403 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 AC084816.1-204ENST00000628326 631 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 ARHGEF38-201ENST00000265154 1437 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 KCNQ3-205ENST00000621976 10659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 LINC00320-204ENST00000437238 2004 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 CBLB-205ENST00000407712 1493 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 PTPN3-202ENST00000374541 6703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 LINC00310-202ENST00000419881 910 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 TMEM246-AS1-202ENST00000425734 466 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AC104411.1-201ENST00000480817 320 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 MTND5P12-201ENST00000502851 1449 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AC022509.3-201ENST00000535914 436 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 GOLT1B-205ENST00000540141 1055 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 A2MP1-201ENST00000543404 1201 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AP000619.2-201ENST00000546014 969 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 BICD1-206ENST00000551086 423 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 MIR4502-201ENST00000580432 81 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AC008543.3-201ENST00000586983 491 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AL034374.2-201ENST00000605281 548 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AP003789.1-201ENST00000617737 605 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AP001052.1-201ENST00000626421 99 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AC079753.1-201ENST00000623243 3868 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AP004289.1-201ENST00000436307 2205 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 USP40-202ENST00000409945 1946 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 HSPD1P9-201ENST00000420325 1636 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 DICER1-202ENST00000393063 10220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 CYLD-207ENST00000564326 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 SPHKAP-201ENST00000344657 6804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AC022325.1-201ENST00000502748 2199 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 UGT2B11-201ENST00000446444 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 PIH1D3-203ENST00000535523 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 CAP1P2-201ENST00000417455 1409 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 OR2G3-201ENST00000320002 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 TRIM69-202ENST00000338264 1222 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 TSLP-201ENST00000344895 736 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 GCNT1P4-201ENST00000404096 329 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 MIR1275-201ENST00000408770 80 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AL512353.1-202ENST00000416809 627 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 RPL12P12-201ENST00000424633 501 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 LINC02522-201ENST00000431401 256 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AL354893.1-201ENST00000433735 348 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 TRIM60P16-201ENST00000444048 694 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 BCAP29-207ENST00000445771 1157 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 KDELR2-206ENST00000490996 655 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AC104078.2-201ENST00000504344 541 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 OR7E99P-201ENST00000505750 922 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 CR383658.1-201ENST00000514609 734 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 HSD3BP3-201ENST00000514706 994 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 CRYAB-205ENST00000526180 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AC090502.3-201ENST00000552046 529 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AC145285.4-201ENST00000568183 540 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 ZNF174-204ENST00000572544 1002 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.6 ms