Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB3

CABP2, Calcium-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP2Q9NPB3 HPS4-201ENST00000336873 3786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CABP2Q9NPB3 DICER1-204ENST00000527414 6179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CABP2Q9NPB3 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CABP2Q9NPB3 CCDC30-202ENST00000342022 3098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CABP2Q9NPB3 RBM5-201ENST00000347869 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CABP2Q9NPB3 EYA3-203ENST00000373871 6085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CABP2Q9NPB3 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CABP2Q9NPB3 AC068733.1-202ENST00000531479 2456 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CABP2Q9NPB3 IL31RA-206ENST00000447346 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CABP2Q9NPB3 SOSTDC1-202ENST00000396652 2411 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CABP2Q9NPB3 MTHFD2L-207ENST00000433372 1407 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CABP2Q9NPB3 MGC32805-205ENST00000510972 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CABP2Q9NPB3 PHACTR2P1-201ENST00000605639 1414 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CABP2Q9NPB3 AC020904.2-202ENST00000614660 1401 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CABP2Q9NPB3 MTHFD1L-212ENST00000618312 3159 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CABP2Q9NPB3 HHAT-204ENST00000413764 3575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CABP2Q9NPB3 CBWD6-203ENST00000456520 1608 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CABP2Q9NPB3 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CABP2Q9NPB3 RPS20-205ENST00000519807 1826 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CABP2Q9NPB3 INSR-202ENST00000341500 8954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CABP2Q9NPB3 PVALB-201ENST00000216200 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CABP2Q9NPB3 HIST1H4F-201ENST00000244537 312 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CABP2Q9NPB3 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CABP2Q9NPB3 OR10A4-201ENST00000379829 995 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CABP2Q9NPB3 MIR27A-201ENST00000385073 78 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CABP2Q9NPB3 IGLV3-12-201ENST00000390313 356 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CABP2Q9NPB3 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CABP2Q9NPB3 BCRP8-201ENST00000412037 255 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CABP2Q9NPB3 AL591368.1-202ENST00000413050 548 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CABP2Q9NPB3 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CABP2Q9NPB3 LINC01829-202ENST00000433133 2100 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CABP2Q9NPB3 RPL35P8-201ENST00000433284 337 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CABP2Q9NPB3 NDUFB3-202ENST00000433898 503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CABP2Q9NPB3 AC108868.2-201ENST00000451464 511 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CABP2Q9NPB3 TRBV5-4-201ENST00000454561 544 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CABP2Q9NPB3 RPL7P24-201ENST00000493052 752 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CABP2Q9NPB3 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CABP2Q9NPB3 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CABP2Q9NPB3 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CABP2Q9NPB3 AC021001.1-201ENST00000518703 987 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CABP2Q9NPB3 CHCHD7-210ENST00000521524 703 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CABP2Q9NPB3 AL590385.2-201ENST00000537821 553 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CABP2Q9NPB3 AC069234.3-201ENST00000544939 569 ntTSL 4 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CABP2Q9NPB3 AC012464.2-201ENST00000551257 779 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CABP2Q9NPB3 AL049780.1-201ENST00000554430 489 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CABP2Q9NPB3 NPM1P5-201ENST00000557228 838 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CABP2Q9NPB3 DRAIC-206ENST00000559029 309 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CABP2Q9NPB3 AC084782.2-201ENST00000561934 839 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CABP2Q9NPB3 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CABP2Q9NPB3 AC006116.6-201ENST00000593258 1103 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CABP2Q9NPB3 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CABP2Q9NPB3 AL021368.3-201ENST00000607119 578 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CABP2Q9NPB3 AC244196.4-201ENST00000611787 392 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CABP2Q9NPB3 MTERF4-222ENST00000614476 4524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CABP2Q9NPB3 LINC01358-211ENST00000635571 1687 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CABP2Q9NPB3 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CABP2Q9NPB3 CREM-207ENST00000356917 1895 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CABP2Q9NPB3 AC106712.1-201ENST00000483840 1888 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CABP2Q9NPB3 SORBS1-208ENST00000371241 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CABP2Q9NPB3 BBS4-201ENST00000268057 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CABP2Q9NPB3 PAN2-221ENST00000610546 5301 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CABP2Q9NPB3 STAT2-202ENST00000418572 1548 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CABP2Q9NPB3 NQO1-203ENST00000379047 2527 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CABP2Q9NPB3 PTPRT-206ENST00000373198 12746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CABP2Q9NPB3 CTD-2201I18.1-202ENST00000514042 2705 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CABP2Q9NPB3 SORCS1-202ENST00000344440 3009 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CABP2Q9NPB3 ZEB2-236ENST00000636471 9583 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CABP2Q9NPB3 BCL2L14-204ENST00000396367 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CABP2Q9NPB3 PAPPA-AS2-201ENST00000438048 1854 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CABP2Q9NPB3 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CABP2Q9NPB3 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CABP2Q9NPB3 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CABP2Q9NPB3 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CABP2Q9NPB3 TPPP2-201ENST00000321760 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CABP2Q9NPB3 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CABP2Q9NPB3 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CABP2Q9NPB3 RNA5SP260-201ENST00000363849 111 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CABP2Q9NPB3 RNA5SP396-201ENST00000364834 120 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CABP2Q9NPB3 RNA5SP302-201ENST00000364896 100 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CABP2Q9NPB3 AC007068.1-201ENST00000396690 844 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CABP2Q9NPB3 AL022724.1-201ENST00000412132 554 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CABP2Q9NPB3 AC096644.3-201ENST00000416788 338 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CABP2Q9NPB3 GAPDHP73-201ENST00000423411 1007 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CABP2Q9NPB3 ARMC4P1-201ENST00000438905 707 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CABP2Q9NPB3 AL450263.2-201ENST00000439400 589 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CABP2Q9NPB3 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CABP2Q9NPB3 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CABP2Q9NPB3 UCK2-206ENST00000470820 1083 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CABP2Q9NPB3 RPS10P28-201ENST00000480396 498 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CABP2Q9NPB3 RPL7AP30-201ENST00000482859 796 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CABP2Q9NPB3 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CABP2Q9NPB3 AC233724.10-201ENST00000510454 409 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CABP2Q9NPB3 AC016559.1-201ENST00000511420 199 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CABP2Q9NPB3 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CABP2Q9NPB3 AP004833.3-201ENST00000531893 322 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CABP2Q9NPB3 AC068631.3-201ENST00000538831 225 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CABP2Q9NPB3 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CABP2Q9NPB3 UBE2CP4-201ENST00000561405 535 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CABP2Q9NPB3 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CABP2Q9NPB3 AC011824.3-201ENST00000585093 563 ntTSL 4 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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