Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W8

SMG9, Protein SMG9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG9Q9H0W8 GIP-201ENST00000357424 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 RBMS3-AS2-201ENST00000366321 582 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 FAUP2-201ENST00000394301 401 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 AL008723.2-201ENST00000426354 562 ntTSL 4 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 AL627224.1-201ENST00000448334 444 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 AC073476.1-201ENST00000452854 407 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 LINC00533-201ENST00000456103 537 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 SSBP1-211ENST00000484178 676 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 AC112206.2-201ENST00000503106 557 ntTSL 4 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 AK4P6-201ENST00000505168 528 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 AC112198.1-201ENST00000505369 1220 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 AC139272.1-201ENST00000505516 640 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 AC108120.1-201ENST00000506543 991 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 SEPT10P1-201ENST00000517342 1162 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 AC016885.1-201ENST00000517796 532 ntTSL 4 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 LINC01339-203ENST00000519336 561 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 AC025524.2-202ENST00000523042 535 ntTSL 4 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 RBMS2P1-201ENST00000525031 1226 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 DDHD2-219ENST00000529845 945 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 AC021979.2-201ENST00000553644 209 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 PSMA3-213ENST00000557508 814 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 TAT-AS1-201ENST00000561529 873 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 C16orf62-224ENST00000567245 573 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 PRELID3BP3-201ENST00000584963 545 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 AP005230.1-201ENST00000585072 675 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 C10orf82-203ENST00000588184 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 AC053481.5-201ENST00000602932 397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 AL137072.1-201ENST00000603444 466 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 SNX29P2-204ENST00000603801 875 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 AL121809.2-201ENST00000613169 341 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 SMR3B-204ENST00000614072 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 AC244196.1-201ENST00000620569 409 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 PDAP1-205ENST00000626285 120 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 MCPH1-201ENST00000344683 8039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 RALYL-211ENST00000523850 1684 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 AL512662.1-201ENST00000624850 2251 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 OR4D10-201ENST00000530162 2482 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 MAPK10-347ENST00000641762 2856 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 MORC1-202ENST00000483760 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 MMACHC-201ENST00000401061 5296 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 PPP2R2B-202ENST00000394409 10704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 LNX1-202ENST00000306888 3757 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 USP3-201ENST00000268049 5311 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 HNRNPC-211ENST00000554455 1784 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 LCP2-206ENST00000521416 1599 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 RNF24-203ENST00000432261 3149 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 HBP1-208ENST00000468410 2704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 NRG3-206ENST00000545131 2713 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 ARHGAP32-202ENST00000392657 6556 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 ESRP1-204ENST00000454170 3482 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 NECAP1-221ENST00000639955 3479 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 SH3BGRL-201ENST00000373212 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 MTFR2-205ENST00000451457 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 PRLR-212ENST00000513753 1525 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 DCX-206ENST00000496551 1320 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 ESRP1-201ENST00000358397 3756 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 ABCC4-201ENST00000376887 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 MUSK-205ENST00000374448 2754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 ALB-203ENST00000415165 1483 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 PTK2-240ENST00000522684 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 AC127502.2-201ENST00000602663 2351 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 AC087501.5-201ENST00000607496 2374 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 OR4A16-201ENST00000314721 1081 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 HNMT-203ENST00000329366 835 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 CDKL4-202ENST00000395035 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 C2orf88-202ENST00000396974 998 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 PPP1R7-203ENST00000401987 820 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 LINC02257-201ENST00000412445 605 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 IPPKP1-201ENST00000422501 768 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 LINC01400-201ENST00000426358 947 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 PA2G4P1-201ENST00000442248 1197 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 PRKACB-213ENST00000446538 1112 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
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