Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 AL663074.2-201ENST00000440621 479 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 AC016908.1-201ENST00000442571 1219 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 SNRPBP1-201ENST00000443634 282 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 LINC01370-202ENST00000445606 731 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 AL355390.2-201ENST00000446691 880 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 AL136115.1-201ENST00000447478 517 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 HSPA8P3-201ENST00000449300 780 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 NREP-207ENST00000450761 636 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 RAB28P2-201ENST00000454299 641 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 AL356364.1-201ENST00000458443 182 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 PEX5L-AS2-201ENST00000462801 630 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 AC015908.1-201ENST00000478739 476 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 EIF4E2P2-201ENST00000492033 736 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 MTERF4-220ENST00000495694 909 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 PTPN20-219ENST00000508602 742 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 PTPN20-221ENST00000509599 945 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 PTPN20-223ENST00000509900 693 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 AC098487.1-203ENST00000512915 546 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 PTPN20-228ENST00000513266 818 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 HNRNPCP8-201ENST00000528764 888 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 AC034102.7-201ENST00000550840 470 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 AL162511.1-201ENST00000556542 879 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 DISC1FP1-202ENST00000562245 774 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 CYP4A26P-201ENST00000563017 196 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 MDFIC2-201ENST00000567252 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 AC087499.3-201ENST00000578210 717 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 BNIP3P39-201ENST00000601077 554 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 AC125494.2-201ENST00000602431 657 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 AL353593.3-201ENST00000602778 764 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 AC074276.2-201ENST00000619891 348 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 AL669830.1-201ENST00000621457 656 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 AC090099.1-204ENST00000623626 849 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 AL035425.4-201ENST00000624509 1063 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 SMARCA2-231ENST00000634931 939 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 LINC01822-201ENST00000435682 2098 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 CYP51A1-204ENST00000450723 1729 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 LINC01958-201ENST00000637749 1941 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 METTL9-211ENST00000615720 2890 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 ZNF630-202ENST00000409324 2455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 CDY11P-201ENST00000447168 1651 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 OR6P1-201ENST00000334632 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 C1orf146-202ENST00000370375 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 LYZL1-201ENST00000375500 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 IGHV1-24-201ENST00000390610 411 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 TIMD4-203ENST00000407087 1145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 AC006547.2-201ENST00000412713 526 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 IFNA12P-201ENST00000413147 571 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 PTCD2P2-201ENST00000415579 1095 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 TEX50-201ENST00000417563 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 AC091492.1-201ENST00000419844 272 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 SOS1-IT1-201ENST00000420644 539 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 LINC01508-202ENST00000436671 755 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 AL445307.1-201ENST00000446476 602 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 AC005517.1-201ENST00000452091 489 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 RN7SL508P-201ENST00000464472 303 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 PFN2-209ENST00000481275 560 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 ZNF525-204ENST00000491101 569 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 CHN2-226ENST00000495789 725 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 LINC02270-201ENST00000505386 610 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 AC091860.2-201ENST00000509423 941 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 AC094105.1-201ENST00000509745 560 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 RNA5SP318-201ENST00000516352 92 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 SEC11B-201ENST00000518383 499 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 AC068205.2-201ENST00000532864 771 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 OR4A43P-201ENST00000532938 908 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 AP001107.4-201ENST00000533576 539 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 AL158058.1-201ENST00000549515 647 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 LINC02413-201ENST00000549914 723 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 AC074029.2-201ENST00000551045 634 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 AL139021.2-201ENST00000556390 399 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 LINC01895-201ENST00000558690 404 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 SPATA8-AS1-202ENST00000560888 392 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 RN7SL192P-201ENST00000584303 299 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 AC021517.1-203ENST00000590257 421 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 ZNF397-211ENST00000592264 1104 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 AL589863.1-201ENST00000595383 631 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125 ms