Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 AC009237.12-201ENST00000604755 742 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 AC004839.1-201ENST00000610269 501 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 XPNPEP3-206ENST00000614001 230 ntTSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 IL13-206ENST00000617259 498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 MALAT1-212ENST00000618132 725 ntTSL 2 BASIC8.12□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 AC025162.2-201ENST00000619602 560 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 RN7SL680P-201ENST00000620379 299 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 PTP4A1-206ENST00000627002 447 ntTSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 PDE4DIP-205ENST00000369354 8262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 TP53BP1-202ENST00000382039 6015 ntTSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 GAPVD1-207ENST00000394105 5207 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 SCN8A-201ENST00000354534 11556 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 GTF2IRD2P1-201ENST00000449689 2749 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 SLC6A16-202ENST00000454748 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 CNOT4-207ENST00000451834 3507 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.12□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 RUNDC3A-AS1-202ENST00000588097 5203 ntTSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 ARHGAP12-204ENST00000375250 4914 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 TDRKH-201ENST00000368822 3093 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 PTK2-240ENST00000522684 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 MYO6-208ENST00000627432 4074 ntTSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 TMX2-201ENST00000278422 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 OR2F1-203ENST00000641412 4829 ntAPPRIS P1 BASIC8.11□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 ZNF286A-202ENST00000395894 5443 ntTSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 CASR-205ENST00000639785 10047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 IFT88-201ENST00000319980 3091 ntTSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.11□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 AC096571.1-201ENST00000325407 306 ntTSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 C1orf54-203ENST00000369102 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 FABP9-201ENST00000379071 497 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.11□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 AL355375.1-201ENST00000405686 392 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 SNORA2C-201ENST00000408564 137 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 AC093642.1-201ENST00000412193 565 ntTSL 3 BASIC8.11□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 AL050320.1-201ENST00000420044 446 ntTSL 2 BASIC8.11□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC8.11□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 AL022100.1-202ENST00000421214 548 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 RPS27AP7-201ENST00000422792 455 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 LINC01445-201ENST00000426205 812 ntTSL 3 BASIC8.11□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 Z68868.1-201ENST00000429048 544 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 AC108039.2-201ENST00000440214 359 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC8.11□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 ZNF619P1-201ENST00000446539 752 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 CDC42P2-201ENST00000448566 569 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 AC108868.2-201ENST00000451464 511 ntTSL 2 BASIC8.11□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 OR7E62P-201ENST00000456741 477 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 AC011005.4-201ENST00000466717 535 ntTSL 3 BASIC8.11□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 SEC62-AS1-201ENST00000479626 346 ntTSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 AC012158.1-202ENST00000482431 1132 ntTSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 RN7SL153P-201ENST00000486501 292 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 AC122710.2-201ENST00000506093 596 ntTSL 4 BASIC8.11□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC8.11□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 AC097375.1-201ENST00000507949 488 ntTSL 3 BASIC8.11□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC8.11□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC8.11□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 AC022973.2-201ENST00000520146 549 ntTSL 4 BASIC8.11□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 AC013644.1-202ENST00000523166 499 ntTSL 2 BASIC8.11□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 OR5AK3P-201ENST00000527486 1297 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 AP001922.2-201ENST00000530435 390 ntTSL 3 BASIC8.11□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 FXYD5-207ENST00000541435 898 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.11□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 AC005832.1-201ENST00000544380 572 ntTSL 4 BASIC8.11□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 PRR13-203ENST00000546581 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.11□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 AC009387.1-201ENST00000549163 441 ntTSL 3 BASIC8.11□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 DLGAP1-AS3-201ENST00000577649 1258 ntTSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 RN7SL311P-201ENST00000579858 306 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 AP002884.5-201ENST00000595053 1132 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 AC005154.6-201ENST00000598361 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 AL022238.3-201ENST00000609279 443 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 AL159169.2-201ENST00000610061 1269 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 AP004607.9-201ENST00000618202 316 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 CCL14-202ENST00000618404 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 AC135068.5-201ENST00000624197 983 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 TM4SF1-201ENST00000305366 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 UFL1-201ENST00000369278 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 TMEM267-202ENST00000500337 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 KIFAP3-203ENST00000367767 2718 ntTSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 DUBR-202ENST00000466734 2737 ntTSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 SRCAP-201ENST00000262518 11754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.11□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 COL21A1-203ENST00000370819 4094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 MS4A7-202ENST00000358246 2871 ntTSL 3 BASIC8.11□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 ADGRL3-214ENST00000511324 5042 ntTSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 LRRC28-201ENST00000301981 5971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 PDE4B-206ENST00000423207 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 KYNUP1-201ENST00000466683 1406 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 PGM3-212ENST00000513973 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms