Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 CU638689.1-201ENST00000623225 897 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
GRIK2Q13002 CU634019.4-201ENST00000623347 897 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
GRIK2Q13002 LINC01440-210ENST00000629744 541 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
GRIK2Q13002 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
GRIK2Q13002 AC027575.3-201ENST00000583058 2747 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
GRIK2Q13002 RASGEF1B-214ENST00000638048 2386 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
GRIK2Q13002 TMPRSS15-201ENST00000284885 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
GRIK2Q13002 AXDND1-201ENST00000367618 3642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
GRIK2Q13002 SORCS1-209ENST00000612154 6862 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK2Q13002 AC105235.1-201ENST00000623208 1816 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK2Q13002 CACNA1E-210ENST00000621791 16171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK2Q13002 MUC5B-204ENST00000529681 17911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK2Q13002 DTNA-228ENST00000597674 1732 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK2Q13002 LGALS17A-201ENST00000412609 2562 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK2Q13002 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK2Q13002 AP002478.1-201ENST00000577848 1455 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK2Q13002 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK2Q13002 AC006213.6-201ENST00000623722 4179 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK2Q13002 TPMT-201ENST00000309983 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK2Q13002 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK2Q13002 NEK2P2-201ENST00000438441 1338 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK2Q13002 OR4N5-202ENST00000641086 2187 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK2Q13002 PRIM2-201ENST00000274891 864 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK2Q13002 SMR3B-201ENST00000304915 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK2Q13002 AC023490.2-201ENST00000359859 470 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK2Q13002 SNORA51.1-201ENST00000363243 140 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK2Q13002 SNORA51.9-201ENST00000384295 124 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK2Q13002 TRAV8-4-201ENST00000390438 469 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK2Q13002 FAIM-204ENST00000393035 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK2Q13002 AL451046.1-201ENST00000406097 534 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK2Q13002 AL512422.1-201ENST00000407033 553 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK2Q13002 RPL23AP18-201ENST00000416139 468 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK2Q13002 AL034397.2-201ENST00000424241 857 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK2Q13002 AP006216.1-201ENST00000439104 419 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK2Q13002 AC108488.1-202ENST00000439547 482 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK2Q13002 AC000111.1-201ENST00000441019 221 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK2Q13002 AC022498.1-201ENST00000449845 696 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK2Q13002 PPIAP27-201ENST00000453800 265 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK2Q13002 VAMP3-202ENST00000470357 954 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK2Q13002 L3HYPDH-206ENST00000487285 700 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK2Q13002 AC109439.2-201ENST00000502421 564 ntTSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK2Q13002 AC025458.1-201ENST00000506046 166 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK2Q13002 AC010387.1-201ENST00000507526 487 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK2Q13002 AC106872.4-201ENST00000510050 523 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK2Q13002 IGKV3D-25-201ENST00000519599 235 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK2Q13002 AC026616.1-201ENST00000523157 525 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK2Q13002 AP001804.1-201ENST00000526868 919 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK2Q13002 AC036111.2-201ENST00000533247 901 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK2Q13002 DCN-209ENST00000546745 1026 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK2Q13002 AC078789.1-201ENST00000547084 477 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK2Q13002 AC092652.2-201ENST00000552220 622 ntTSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK2Q13002 AC117569.1-201ENST00000584482 739 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK2Q13002 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK2Q13002 AL356986.1-201ENST00000604085 341 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK2Q13002 AC073046.2-201ENST00000604756 527 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK2Q13002 AC016590.3-201ENST00000611171 753 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK2Q13002 RSU1P2-204ENST00000619977 1240 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK2Q13002 FO681491.1-202ENST00000623392 737 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK2Q13002 RBMS3-AS2-206ENST00000629296 438 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK2Q13002 PTK2-201ENST00000340930 4414 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK2Q13002 AC106038.1-201ENST00000501194 3473 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK2Q13002 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK2Q13002 PPP4R1L-209ENST00000497138 4680 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK2Q13002 LINC01751-201ENST00000569178 1770 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK2Q13002 GIGYF2-246ENST00000629305 7878 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK2Q13002 CTNND1-212ENST00000525902 4984 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK2Q13002 CTNND1-214ENST00000526772 4966 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK2Q13002 KCNMA1-AS1-202ENST00000429850 3566 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK2Q13002 ZNF138-206ENST00000440598 2230 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
GRIK2Q13002 ZNF836-201ENST00000322146 2811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
GRIK2Q13002 CLEC4E-201ENST00000299663 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
GRIK2Q13002 STT3A-214ENST00000531491 2160 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
GRIK2Q13002 IFRD1-216ENST00000535603 3397 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
GRIK2Q13002 AC005154.1-228ENST00000454922 1405 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
GRIK2Q13002 C14orf105-201ENST00000216445 3082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
GRIK2Q13002 AC084816.1-210ENST00000540895 1920 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
GRIK2Q13002 ZNF766-201ENST00000439461 6298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
GRIK2Q13002 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
GRIK2Q13002 PDZRN4-201ENST00000298919 3411 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
GRIK2Q13002 MAGEB16-204ENST00000399989 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
GRIK2Q13002 ASNS-209ENST00000444334 1812 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
GRIK2Q13002 FUNDC2P3-201ENST00000334716 533 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
GRIK2Q13002 AL451142.1-201ENST00000375867 775 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
GRIK2Q13002 RN7SKP281-201ENST00000410472 352 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
GRIK2Q13002 RN7SKP161-201ENST00000411110 305 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
GRIK2Q13002 AL137071.1-201ENST00000422150 243 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
GRIK2Q13002 AC112492.2-201ENST00000432774 1030 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
GRIK2Q13002 AL049594.1-201ENST00000432834 805 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
GRIK2Q13002 AL133329.1-201ENST00000437466 478 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
GRIK2Q13002 AC073109.1-201ENST00000445066 978 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
GRIK2Q13002 RSL24D1P2-201ENST00000445584 366 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
GRIK2Q13002 SEPHS1P4-201ENST00000446112 1176 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
GRIK2Q13002 AP000402.1-201ENST00000446404 540 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
GRIK2Q13002 HLA-DPA3-207ENST00000454398 229 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
GRIK2Q13002 AC011625.1-201ENST00000455442 526 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
GRIK2Q13002 LINC01780-202ENST00000457683 391 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
GRIK2Q13002 AL133372.1-201ENST00000493565 745 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
GRIK2Q13002 RN7SL104P-201ENST00000498686 293 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
GRIK2Q13002 AC108941.2-201ENST00000506796 716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
GRIK2Q13002 AC006499.4-201ENST00000510947 694 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
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