Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 LINC01951-201ENST00000377300 1925 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 ACOD1-202ENST00000449753 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 TRPC4-207ENST00000426868 2709 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 LINC02388-201ENST00000550678 1975 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 CDON-202ENST00000392693 9138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 PPP1R7-203ENST00000401987 820 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 AL359885.1-201ENST00000415786 903 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 AC107079.1-201ENST00000416509 669 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 UBE2V2P3-201ENST00000433562 437 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 OR3D1P-201ENST00000438288 955 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 AL358074.1-201ENST00000444800 509 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 KRTAP2-5P-201ENST00000446109 396 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 ZNF619P1-201ENST00000446539 752 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 AC104339.1-201ENST00000465478 348 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 PFN2-209ENST00000481275 560 ntTSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 CYP4F27P-201ENST00000514557 494 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 AC008429.4-201ENST00000521201 182 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 AC084125.1-201ENST00000525461 429 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 AP001528.2-201ENST00000528660 1156 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 LINC01580-202ENST00000555364 661 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 AC010547.7-201ENST00000570323 333 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 AC011468.3-201ENST00000597886 332 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 AC107905.1-201ENST00000616204 426 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 AC244100.4-201ENST00000617747 388 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 AL357562.1-201ENST00000624911 609 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 MEIOC-202ENST00000409464 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 ENTPD1-AS1-212ENST00000458228 3274 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 ADAM5-208ENST00000505455 1998 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 NBPF12-205ENST00000617614 4630 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 RASSF8-216ENST00000615708 1328 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 POLA1-202ENST00000379068 5486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 HMG20A-201ENST00000336216 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 SLC2A14-221ENST00000616981 3366 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 MS4A7-211ENST00000534016 1378 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 POLQ-204ENST00000621776 9055 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 TRPM6-204ENST00000449912 8244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 AC027575.3-201ENST00000583058 2747 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 ZCCHC6-202ENST00000375947 611 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 GCNT1P4-201ENST00000404096 329 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 AL096711.1-201ENST00000404780 554 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 SNORA77.2-201ENST00000408571 112 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 MIR1275-201ENST00000408770 80 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 RN7SKP144-201ENST00000411108 279 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 LINC01638-201ENST00000418271 552 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 TMEM246-AS1-202ENST00000425734 466 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 AC108051.1-201ENST00000435291 549 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 LINC01133-202ENST00000443364 1266 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 PPIAP7-201ENST00000454070 489 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 MIR205HG-209ENST00000458250 406 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 RN7SKP35-201ENST00000517210 151 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 IGKV3D-25-201ENST00000519599 235 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 AC013644.1-201ENST00000523724 555 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 AP000620.1-201ENST00000527147 504 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 AP002370.2-201ENST00000531424 545 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 TRAV11-201ENST00000539512 339 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 AP003774.2-201ENST00000569737 558 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 LINC01533-204ENST00000590719 435 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 CT45A1-201ENST00000594117 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 VN1R81P-201ENST00000602085 372 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 AC068768.2-201ENST00000602352 343 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
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HOXD13P35453 AC096861.1-201ENST00000616652 240 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 RFPL4AP6-201ENST00000616792 846 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 CKLF-CMTM1-206ENST00000616804 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 AL512652.1-201ENST00000619006 500 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 TCF12-214ENST00000559710 1314 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 TEX9-209ENST00000561221 2297 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 CNTN5-204ENST00000524871 6258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 KMT2C-201ENST00000262189 16862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 KMT2C-202ENST00000355193 16858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 AL354854.1-201ENST00000455940 1363 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 FAM227A-205ENST00000535113 10322 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 ZNF292-201ENST00000339907 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 AC068769.1-201ENST00000474767 2426 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 AC005225.5-201ENST00000623547 2225 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 ASNS-209ENST00000444334 1812 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 AC092828.1-201ENST00000501211 5391 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 AL020995.1-201ENST00000427524 1680 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 TRAV8-4-201ENST00000390438 469 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
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