Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 HSD17B4-202ENST00000414835 2551 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 ESF1-201ENST00000202816 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 SEC61A2-202ENST00000304267 2030 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 AKAP17BP-201ENST00000431706 2719 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 STMN2-201ENST00000220876 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 TXK-201ENST00000264316 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 OR2H1-201ENST00000377132 2253 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 TRIM64-201ENST00000533122 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 LINC02388-201ENST00000550678 1975 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 AC009965.1-201ENST00000411436 570 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 AL513348.1-201ENST00000435554 440 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 LDHAP2-201ENST00000437325 985 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 AL356121.1-201ENST00000442911 156 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 SEPHS1P4-201ENST00000446112 1176 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 HRAT17-202ENST00000451962 687 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 SNRPCP11-201ENST00000492453 205 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 LINC01322-202ENST00000494915 594 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 LINC02503-201ENST00000510505 812 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 CLEC2B-202ENST00000538152 745 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 AL157871.6-201ENST00000553954 206 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 AC004034.1-201ENST00000573260 510 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 WBP1LP11-201ENST00000586141 328 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 Z98949.1-204ENST00000595102 731 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 AP000654.1-201ENST00000602510 1192 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 AC244205.1-201ENST00000624935 705 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 EIF3EP1-201ENST00000433978 1316 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 SERPINB7-206ENST00000540675 2193 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 C5orf64-203ENST00000505642 2970 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 ATP13A4-204ENST00000400270 1458 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 AL354696.2-201ENST00000619407 1910 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 HOXD8-202ENST00000429017 1608 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 DHRS9-204ENST00000428522 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 OR4N5-202ENST00000641086 2187 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 PUS3-203ENST00000530811 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 FCGR1B-202ENST00000369383 570 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 SNORA77.2-201ENST00000408571 112 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 AC000058.1-201ENST00000415249 536 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 RPS7P8-201ENST00000418311 581 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 MS4A6A-202ENST00000420732 863 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 FAM183DP-201ENST00000421987 399 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 AC010086.1-201ENST00000437359 1052 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 AL512593.1-201ENST00000444758 779 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 AC002075.1-201ENST00000457396 676 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 H3F3AP5-201ENST00000475267 429 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 LINC02114-201ENST00000503757 801 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 RNA5SP434-201ENST00000516647 121 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
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CLDN9O95484 LRTOMT-218ENST00000541614 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 AC022523.1-201ENST00000560360 364 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 LINC01908-201ENST00000583148 555 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 NDUFB9P1-201ENST00000604683 510 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 AC091769.2-201ENST00000605385 479 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 SLC8A1-AS1-218ENST00000610721 956 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 MIR6889-201ENST00000613185 59 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 OSTC-205ENST00000613215 876 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 AC005899.7-201ENST00000618199 588 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 AF067845.4-201ENST00000633198 480 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 AC063952.1-203ENST00000634410 658 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 AC010325.3-201ENST00000641084 394 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 AL606516.1-201ENST00000455438 1861 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 KCNJ16-205ENST00000586462 1897 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 KLHL41-201ENST00000284669 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 TTC39B-207ENST00000507993 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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