Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP16Q9Y5T5 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP16Q9Y5T5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP16Q9Y5T5 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP16Q9Y5T5 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
USP16Q9Y5T5 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP16Q9Y5T5 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP16Q9Y5T5 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
USP16Q9Y5T5 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP16Q9Y5T5 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
USP16Q9Y5T5 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP16Q9Y5T5 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP16Q9Y5T5 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP16Q9Y5T5 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP16Q9Y5T5 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP16Q9Y5T5 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP16Q9Y5T5 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP16Q9Y5T5 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP16Q9Y5T5 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP16Q9Y5T5 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP16Q9Y5T5 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP16Q9Y5T5 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
USP16Q9Y5T5 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP16Q9Y5T5 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP16Q9Y5T5 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP16Q9Y5T5 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP16Q9Y5T5 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP16Q9Y5T5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP16Q9Y5T5 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP16Q9Y5T5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP16Q9Y5T5 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP16Q9Y5T5 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP16Q9Y5T5 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP16Q9Y5T5 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP16Q9Y5T5 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP16Q9Y5T5 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP16Q9Y5T5 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
USP16Q9Y5T5 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP16Q9Y5T5 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP16Q9Y5T5 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
USP16Q9Y5T5 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP16Q9Y5T5 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP16Q9Y5T5 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP16Q9Y5T5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP16Q9Y5T5 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP16Q9Y5T5 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP16Q9Y5T5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP16Q9Y5T5 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP16Q9Y5T5 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
USP16Q9Y5T5 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP16Q9Y5T5 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP16Q9Y5T5 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP16Q9Y5T5 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP16Q9Y5T5 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP16Q9Y5T5 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP16Q9Y5T5 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP16Q9Y5T5 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP16Q9Y5T5 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP16Q9Y5T5 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP16Q9Y5T5 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP16Q9Y5T5 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP16Q9Y5T5 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP16Q9Y5T5 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP16Q9Y5T5 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP16Q9Y5T5 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP16Q9Y5T5 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP16Q9Y5T5 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP16Q9Y5T5 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP16Q9Y5T5 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP16Q9Y5T5 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP16Q9Y5T5 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP16Q9Y5T5 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP16Q9Y5T5 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
USP16Q9Y5T5 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP16Q9Y5T5 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP16Q9Y5T5 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP16Q9Y5T5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP16Q9Y5T5 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP16Q9Y5T5 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP16Q9Y5T5 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms