Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B0

CTDP1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1Q9Y5B0 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTDP1Q9Y5B0 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTDP1Q9Y5B0 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTDP1Q9Y5B0 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTDP1Q9Y5B0 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTDP1Q9Y5B0 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CTDP1Q9Y5B0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTDP1Q9Y5B0 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTDP1Q9Y5B0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTDP1Q9Y5B0 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTDP1Q9Y5B0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTDP1Q9Y5B0 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTDP1Q9Y5B0 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTDP1Q9Y5B0 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTDP1Q9Y5B0 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTDP1Q9Y5B0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTDP1Q9Y5B0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTDP1Q9Y5B0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTDP1Q9Y5B0 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTDP1Q9Y5B0 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTDP1Q9Y5B0 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTDP1Q9Y5B0 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTDP1Q9Y5B0 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTDP1Q9Y5B0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTDP1Q9Y5B0 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTDP1Q9Y5B0 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTDP1Q9Y5B0 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTDP1Q9Y5B0 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTDP1Q9Y5B0 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTDP1Q9Y5B0 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTDP1Q9Y5B0 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTDP1Q9Y5B0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTDP1Q9Y5B0 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTDP1Q9Y5B0 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTDP1Q9Y5B0 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTDP1Q9Y5B0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTDP1Q9Y5B0 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTDP1Q9Y5B0 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTDP1Q9Y5B0 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTDP1Q9Y5B0 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTDP1Q9Y5B0 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTDP1Q9Y5B0 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTDP1Q9Y5B0 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CTDP1Q9Y5B0 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTDP1Q9Y5B0 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTDP1Q9Y5B0 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTDP1Q9Y5B0 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTDP1Q9Y5B0 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTDP1Q9Y5B0 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTDP1Q9Y5B0 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTDP1Q9Y5B0 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CTDP1Q9Y5B0 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTDP1Q9Y5B0 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTDP1Q9Y5B0 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTDP1Q9Y5B0 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTDP1Q9Y5B0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTDP1Q9Y5B0 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTDP1Q9Y5B0 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTDP1Q9Y5B0 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CTDP1Q9Y5B0 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTDP1Q9Y5B0 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTDP1Q9Y5B0 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTDP1Q9Y5B0 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTDP1Q9Y5B0 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CTDP1Q9Y5B0 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTDP1Q9Y5B0 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTDP1Q9Y5B0 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTDP1Q9Y5B0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTDP1Q9Y5B0 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTDP1Q9Y5B0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTDP1Q9Y5B0 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms