Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CAB39Q9Y376 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms