Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X3

NOP58, Nucleolar protein 58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP58Q9Y2X3 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NOP58Q9Y2X3 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms