Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
TRAPPC8Q9Y2L5 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
TRAPPC8Q9Y2L5 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TRAPPC8Q9Y2L5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TRAPPC8Q9Y2L5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TRAPPC8Q9Y2L5 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TRAPPC8Q9Y2L5 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TRAPPC8Q9Y2L5 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TRAPPC8Q9Y2L5 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TRAPPC8Q9Y2L5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TRAPPC8Q9Y2L5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TRAPPC8Q9Y2L5 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TRAPPC8Q9Y2L5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
TRAPPC8Q9Y2L5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TRAPPC8Q9Y2L5 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TRAPPC8Q9Y2L5 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TRAPPC8Q9Y2L5 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TRAPPC8Q9Y2L5 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TRAPPC8Q9Y2L5 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TRAPPC8Q9Y2L5 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
TRAPPC8Q9Y2L5 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
TRAPPC8Q9Y2L5 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TRAPPC8Q9Y2L5 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TRAPPC8Q9Y2L5 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TRAPPC8Q9Y2L5 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TRAPPC8Q9Y2L5 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TRAPPC8Q9Y2L5 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TRAPPC8Q9Y2L5 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TRAPPC8Q9Y2L5 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TRAPPC8Q9Y2L5 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TRAPPC8Q9Y2L5 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TRAPPC8Q9Y2L5 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TRAPPC8Q9Y2L5 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
TRAPPC8Q9Y2L5 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
TRAPPC8Q9Y2L5 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TRAPPC8Q9Y2L5 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRAPPC8Q9Y2L5 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRAPPC8Q9Y2L5 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRAPPC8Q9Y2L5 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRAPPC8Q9Y2L5 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRAPPC8Q9Y2L5 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRAPPC8Q9Y2L5 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRAPPC8Q9Y2L5 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRAPPC8Q9Y2L5 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRAPPC8Q9Y2L5 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRAPPC8Q9Y2L5 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRAPPC8Q9Y2L5 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRAPPC8Q9Y2L5 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRAPPC8Q9Y2L5 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRAPPC8Q9Y2L5 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRAPPC8Q9Y2L5 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRAPPC8Q9Y2L5 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRAPPC8Q9Y2L5 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
TRAPPC8Q9Y2L5 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRAPPC8Q9Y2L5 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRAPPC8Q9Y2L5 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRAPPC8Q9Y2L5 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRAPPC8Q9Y2L5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRAPPC8Q9Y2L5 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRAPPC8Q9Y2L5 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRAPPC8Q9Y2L5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRAPPC8Q9Y2L5 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRAPPC8Q9Y2L5 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
TRAPPC8Q9Y2L5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRAPPC8Q9Y2L5 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRAPPC8Q9Y2L5 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRAPPC8Q9Y2L5 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
TRAPPC8Q9Y2L5 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRAPPC8Q9Y2L5 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRAPPC8Q9Y2L5 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRAPPC8Q9Y2L5 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRAPPC8Q9Y2L5 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRAPPC8Q9Y2L5 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TRAPPC8Q9Y2L5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TRAPPC8Q9Y2L5 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TRAPPC8Q9Y2L5 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
TRAPPC8Q9Y2L5 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
TRAPPC8Q9Y2L5 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
TRAPPC8Q9Y2L5 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
TRAPPC8Q9Y2L5 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
TRAPPC8Q9Y2L5 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
TRAPPC8Q9Y2L5 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
TRAPPC8Q9Y2L5 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
TRAPPC8Q9Y2L5 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
TRAPPC8Q9Y2L5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRAPPC8Q9Y2L5 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRAPPC8Q9Y2L5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRAPPC8Q9Y2L5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRAPPC8Q9Y2L5 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
TRAPPC8Q9Y2L5 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRAPPC8Q9Y2L5 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRAPPC8Q9Y2L5 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7 ms