Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms