Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV7

PHF24, PHD finger protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF24Q9UPV7 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHF24Q9UPV7 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHF24Q9UPV7 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHF24Q9UPV7 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHF24Q9UPV7 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHF24Q9UPV7 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHF24Q9UPV7 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHF24Q9UPV7 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHF24Q9UPV7 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHF24Q9UPV7 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHF24Q9UPV7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHF24Q9UPV7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHF24Q9UPV7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHF24Q9UPV7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHF24Q9UPV7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHF24Q9UPV7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHF24Q9UPV7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHF24Q9UPV7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHF24Q9UPV7 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHF24Q9UPV7 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHF24Q9UPV7 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PHF24Q9UPV7 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PHF24Q9UPV7 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHF24Q9UPV7 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PHF24Q9UPV7 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHF24Q9UPV7 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHF24Q9UPV7 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHF24Q9UPV7 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHF24Q9UPV7 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHF24Q9UPV7 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PHF24Q9UPV7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF24Q9UPV7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF24Q9UPV7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF24Q9UPV7 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF24Q9UPV7 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF24Q9UPV7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF24Q9UPV7 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF24Q9UPV7 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF24Q9UPV7 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF24Q9UPV7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF24Q9UPV7 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF24Q9UPV7 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHF24Q9UPV7 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHF24Q9UPV7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHF24Q9UPV7 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHF24Q9UPV7 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHF24Q9UPV7 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHF24Q9UPV7 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PHF24Q9UPV7 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PHF24Q9UPV7 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHF24Q9UPV7 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHF24Q9UPV7 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHF24Q9UPV7 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHF24Q9UPV7 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PHF24Q9UPV7 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHF24Q9UPV7 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PHF24Q9UPV7 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHF24Q9UPV7 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHF24Q9UPV7 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHF24Q9UPV7 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHF24Q9UPV7 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHF24Q9UPV7 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHF24Q9UPV7 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHF24Q9UPV7 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHF24Q9UPV7 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHF24Q9UPV7 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PHF24Q9UPV7 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHF24Q9UPV7 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHF24Q9UPV7 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHF24Q9UPV7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHF24Q9UPV7 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHF24Q9UPV7 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHF24Q9UPV7 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHF24Q9UPV7 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PHF24Q9UPV7 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PHF24Q9UPV7 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PHF24Q9UPV7 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHF24Q9UPV7 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHF24Q9UPV7 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PHF24Q9UPV7 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHF24Q9UPV7 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHF24Q9UPV7 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHF24Q9UPV7 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHF24Q9UPV7 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHF24Q9UPV7 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHF24Q9UPV7 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHF24Q9UPV7 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHF24Q9UPV7 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PHF24Q9UPV7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHF24Q9UPV7 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHF24Q9UPV7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHF24Q9UPV7 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHF24Q9UPV7 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHF24Q9UPV7 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHF24Q9UPV7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHF24Q9UPV7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PHF24Q9UPV7 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PHF24Q9UPV7 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PHF24Q9UPV7 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PHF24Q9UPV7 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms