Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF18Q9UNG2 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms