Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ2

SYNRG, Synergin gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNRGQ9UMZ2 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNRGQ9UMZ2 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNRGQ9UMZ2 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNRGQ9UMZ2 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNRGQ9UMZ2 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNRGQ9UMZ2 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNRGQ9UMZ2 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNRGQ9UMZ2 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNRGQ9UMZ2 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNRGQ9UMZ2 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNRGQ9UMZ2 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNRGQ9UMZ2 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNRGQ9UMZ2 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNRGQ9UMZ2 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNRGQ9UMZ2 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNRGQ9UMZ2 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNRGQ9UMZ2 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNRGQ9UMZ2 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNRGQ9UMZ2 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNRGQ9UMZ2 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNRGQ9UMZ2 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNRGQ9UMZ2 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNRGQ9UMZ2 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNRGQ9UMZ2 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNRGQ9UMZ2 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNRGQ9UMZ2 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNRGQ9UMZ2 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNRGQ9UMZ2 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNRGQ9UMZ2 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNRGQ9UMZ2 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNRGQ9UMZ2 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNRGQ9UMZ2 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNRGQ9UMZ2 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNRGQ9UMZ2 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNRGQ9UMZ2 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNRGQ9UMZ2 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNRGQ9UMZ2 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNRGQ9UMZ2 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNRGQ9UMZ2 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNRGQ9UMZ2 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNRGQ9UMZ2 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNRGQ9UMZ2 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNRGQ9UMZ2 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNRGQ9UMZ2 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNRGQ9UMZ2 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNRGQ9UMZ2 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNRGQ9UMZ2 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNRGQ9UMZ2 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNRGQ9UMZ2 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNRGQ9UMZ2 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNRGQ9UMZ2 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNRGQ9UMZ2 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNRGQ9UMZ2 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNRGQ9UMZ2 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNRGQ9UMZ2 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNRGQ9UMZ2 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNRGQ9UMZ2 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNRGQ9UMZ2 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNRGQ9UMZ2 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNRGQ9UMZ2 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNRGQ9UMZ2 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNRGQ9UMZ2 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNRGQ9UMZ2 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNRGQ9UMZ2 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNRGQ9UMZ2 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNRGQ9UMZ2 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNRGQ9UMZ2 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNRGQ9UMZ2 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNRGQ9UMZ2 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNRGQ9UMZ2 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNRGQ9UMZ2 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNRGQ9UMZ2 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNRGQ9UMZ2 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNRGQ9UMZ2 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNRGQ9UMZ2 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNRGQ9UMZ2 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNRGQ9UMZ2 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNRGQ9UMZ2 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNRGQ9UMZ2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNRGQ9UMZ2 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms