Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BRPF3Q9ULD4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms