Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCN11AQ9UI33 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCN11AQ9UI33 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCN11AQ9UI33 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCN11AQ9UI33 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCN11AQ9UI33 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SCN11AQ9UI33 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCN11AQ9UI33 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCN11AQ9UI33 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCN11AQ9UI33 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCN11AQ9UI33 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCN11AQ9UI33 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SCN11AQ9UI33 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SCN11AQ9UI33 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCN11AQ9UI33 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCN11AQ9UI33 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCN11AQ9UI33 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCN11AQ9UI33 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCN11AQ9UI33 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCN11AQ9UI33 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCN11AQ9UI33 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCN11AQ9UI33 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCN11AQ9UI33 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCN11AQ9UI33 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCN11AQ9UI33 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCN11AQ9UI33 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCN11AQ9UI33 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCN11AQ9UI33 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCN11AQ9UI33 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCN11AQ9UI33 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCN11AQ9UI33 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCN11AQ9UI33 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCN11AQ9UI33 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCN11AQ9UI33 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCN11AQ9UI33 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCN11AQ9UI33 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCN11AQ9UI33 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCN11AQ9UI33 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCN11AQ9UI33 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SCN11AQ9UI33 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCN11AQ9UI33 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCN11AQ9UI33 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCN11AQ9UI33 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCN11AQ9UI33 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCN11AQ9UI33 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCN11AQ9UI33 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCN11AQ9UI33 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCN11AQ9UI33 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCN11AQ9UI33 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCN11AQ9UI33 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCN11AQ9UI33 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCN11AQ9UI33 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCN11AQ9UI33 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCN11AQ9UI33 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCN11AQ9UI33 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCN11AQ9UI33 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SCN11AQ9UI33 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCN11AQ9UI33 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCN11AQ9UI33 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
SCN11AQ9UI33 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCN11AQ9UI33 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms