Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CLIP2Q9UDT6 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms