Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.27■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APEX2Q9UBZ4 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms