Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms