Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC40.64■■■■■ 4.1
CCDC180Q9P1Z9 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.64■■■■■ 4.1
CCDC180Q9P1Z9 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
CCDC180Q9P1Z9 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
CCDC180Q9P1Z9 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC40.64■■■■■ 4.1
CCDC180Q9P1Z9 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC40.64■■■■■ 4.1
CCDC180Q9P1Z9 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC40.64■■■■■ 4.1
CCDC180Q9P1Z9 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC40.64■■■■■ 4.1
CCDC180Q9P1Z9 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.1
CCDC180Q9P1Z9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC40.63■■■■■ 4.1
CCDC180Q9P1Z9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC40.63■■■■■ 4.1
CCDC180Q9P1Z9 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC40.63■■■■■ 4.09
CCDC180Q9P1Z9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
CCDC180Q9P1Z9 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
CCDC180Q9P1Z9 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC40.63■■■■■ 4.09
CCDC180Q9P1Z9 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC40.63■■■■■ 4.09
CCDC180Q9P1Z9 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC40.63■■■■■ 4.09
CCDC180Q9P1Z9 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
CCDC180Q9P1Z9 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC40.62■■■■■ 4.09
CCDC180Q9P1Z9 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
CCDC180Q9P1Z9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC40.62■■■■■ 4.09
CCDC180Q9P1Z9 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC40.62■■■■■ 4.09
CCDC180Q9P1Z9 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC40.62■■■■■ 4.09
CCDC180Q9P1Z9 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.62■■■■■ 4.09
CCDC180Q9P1Z9 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
CCDC180Q9P1Z9 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
CCDC180Q9P1Z9 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC40.62■■■■■ 4.09
CCDC180Q9P1Z9 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
CCDC180Q9P1Z9 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC40.61■■■■■ 4.09
CCDC180Q9P1Z9 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC40.61■■■■■ 4.09
CCDC180Q9P1Z9 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC40.61■■■■■ 4.09
CCDC180Q9P1Z9 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC40.61■■■■■ 4.09
CCDC180Q9P1Z9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.61■■■■■ 4.09
CCDC180Q9P1Z9 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
CCDC180Q9P1Z9 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
CCDC180Q9P1Z9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
CCDC180Q9P1Z9 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC40.6■■■■■ 4.09
CCDC180Q9P1Z9 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC40.6■■■■■ 4.09
CCDC180Q9P1Z9 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
CCDC180Q9P1Z9 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
CCDC180Q9P1Z9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.6■■■■■ 4.09
CCDC180Q9P1Z9 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC40.6■■■■■ 4.09
CCDC180Q9P1Z9 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
CCDC180Q9P1Z9 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC40.6■■■■■ 4.09
CCDC180Q9P1Z9 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC40.6■■■■■ 4.09
CCDC180Q9P1Z9 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC40.6■■■■■ 4.09
CCDC180Q9P1Z9 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC40.59■■■■■ 4.09
CCDC180Q9P1Z9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.59■■■■■ 4.09
CCDC180Q9P1Z9 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
CCDC180Q9P1Z9 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
CCDC180Q9P1Z9 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC40.59■■■■■ 4.09
CCDC180Q9P1Z9 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC40.59■■■■■ 4.09
CCDC180Q9P1Z9 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC40.59■■■■■ 4.09
CCDC180Q9P1Z9 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
CCDC180Q9P1Z9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
CCDC180Q9P1Z9 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
CCDC180Q9P1Z9 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.58■■■■■ 4.09
CCDC180Q9P1Z9 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC40.58■■■■■ 4.09
CCDC180Q9P1Z9 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
CCDC180Q9P1Z9 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC40.58■■■■■ 4.09
CCDC180Q9P1Z9 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
CCDC180Q9P1Z9 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC40.58■■■■■ 4.09
CCDC180Q9P1Z9 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC40.58■■■■■ 4.09
CCDC180Q9P1Z9 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC40.58■■■■■ 4.09
CCDC180Q9P1Z9 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
CCDC180Q9P1Z9 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC40.58■■■■■ 4.09
CCDC180Q9P1Z9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
CCDC180Q9P1Z9 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
CCDC180Q9P1Z9 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC40.57■■■■■ 4.09
CCDC180Q9P1Z9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC40.57■■■■■ 4.09
CCDC180Q9P1Z9 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
CCDC180Q9P1Z9 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
CCDC180Q9P1Z9 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.56■■■■■ 4.08
CCDC180Q9P1Z9 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
CCDC180Q9P1Z9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.56■■■■■ 4.08
CCDC180Q9P1Z9 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.56■■■■■ 4.08
CCDC180Q9P1Z9 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
CCDC180Q9P1Z9 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
CCDC180Q9P1Z9 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC40.56■■■■■ 4.08
CCDC180Q9P1Z9 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC40.56■■■■■ 4.08
CCDC180Q9P1Z9 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
CCDC180Q9P1Z9 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC40.56■■■■■ 4.08
CCDC180Q9P1Z9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC40.55■■■■■ 4.08
CCDC180Q9P1Z9 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC40.55■■■■■ 4.08
CCDC180Q9P1Z9 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC40.55■■■■■ 4.08
CCDC180Q9P1Z9 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC40.55■■■■■ 4.08
CCDC180Q9P1Z9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
CCDC180Q9P1Z9 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
CCDC180Q9P1Z9 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC40.55■■■■■ 4.08
CCDC180Q9P1Z9 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.55■■■■■ 4.08
CCDC180Q9P1Z9 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC40.55■■■■■ 4.08
CCDC180Q9P1Z9 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC40.55■■■■■ 4.08
CCDC180Q9P1Z9 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
CCDC180Q9P1Z9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
CCDC180Q9P1Z9 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC40.55■■■■■ 4.08
CCDC180Q9P1Z9 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC40.54■■■■■ 4.08
CCDC180Q9P1Z9 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC40.54■■■■■ 4.08
CCDC180Q9P1Z9 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.54■■■■■ 4.08
CCDC180Q9P1Z9 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
CCDC180Q9P1Z9 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108 ms