Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZV6

MSRB1, Methionine-R-sulfoxide reductase B1, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRB1Q9NZV6 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
MSRB1Q9NZV6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MSRB1Q9NZV6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MSRB1Q9NZV6 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MSRB1Q9NZV6 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MSRB1Q9NZV6 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MSRB1Q9NZV6 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
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