Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
EHD3Q9NZN3 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EHD3Q9NZN3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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