Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ7

DLL3, Delta-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL3Q9NYJ7 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DLL3Q9NYJ7 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms