Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC6

MED17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED17Q9NVC6 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MED17Q9NVC6 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MED17Q9NVC6 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MED17Q9NVC6 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MED17Q9NVC6 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MED17Q9NVC6 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MED17Q9NVC6 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MED17Q9NVC6 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MED17Q9NVC6 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MED17Q9NVC6 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MED17Q9NVC6 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MED17Q9NVC6 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MED17Q9NVC6 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MED17Q9NVC6 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MED17Q9NVC6 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MED17Q9NVC6 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MED17Q9NVC6 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MED17Q9NVC6 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MED17Q9NVC6 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MED17Q9NVC6 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MED17Q9NVC6 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MED17Q9NVC6 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MED17Q9NVC6 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MED17Q9NVC6 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MED17Q9NVC6 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MED17Q9NVC6 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MED17Q9NVC6 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MED17Q9NVC6 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MED17Q9NVC6 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MED17Q9NVC6 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MED17Q9NVC6 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MED17Q9NVC6 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MED17Q9NVC6 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MED17Q9NVC6 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MED17Q9NVC6 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MED17Q9NVC6 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MED17Q9NVC6 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MED17Q9NVC6 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MED17Q9NVC6 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MED17Q9NVC6 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MED17Q9NVC6 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MED17Q9NVC6 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MED17Q9NVC6 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MED17Q9NVC6 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MED17Q9NVC6 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MED17Q9NVC6 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MED17Q9NVC6 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MED17Q9NVC6 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MED17Q9NVC6 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MED17Q9NVC6 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MED17Q9NVC6 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MED17Q9NVC6 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MED17Q9NVC6 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MED17Q9NVC6 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MED17Q9NVC6 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MED17Q9NVC6 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MED17Q9NVC6 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MED17Q9NVC6 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MED17Q9NVC6 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MED17Q9NVC6 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MED17Q9NVC6 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MED17Q9NVC6 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MED17Q9NVC6 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MED17Q9NVC6 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MED17Q9NVC6 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MED17Q9NVC6 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MED17Q9NVC6 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MED17Q9NVC6 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MED17Q9NVC6 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MED17Q9NVC6 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MED17Q9NVC6 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MED17Q9NVC6 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MED17Q9NVC6 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MED17Q9NVC6 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MED17Q9NVC6 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MED17Q9NVC6 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MED17Q9NVC6 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MED17Q9NVC6 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MED17Q9NVC6 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MED17Q9NVC6 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MED17Q9NVC6 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MED17Q9NVC6 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MED17Q9NVC6 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MED17Q9NVC6 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MED17Q9NVC6 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MED17Q9NVC6 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MED17Q9NVC6 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MED17Q9NVC6 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MED17Q9NVC6 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MED17Q9NVC6 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MED17Q9NVC6 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MED17Q9NVC6 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MED17Q9NVC6 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MED17Q9NVC6 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
MED17Q9NVC6 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MED17Q9NVC6 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MED17Q9NVC6 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MED17Q9NVC6 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms