Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms