Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOMER3Q9NSC5 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms