Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF2

SH2B1, SH2B adapter protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2B1Q9NRF2 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SH2B1Q9NRF2 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SH2B1Q9NRF2 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SH2B1Q9NRF2 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SH2B1Q9NRF2 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SH2B1Q9NRF2 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SH2B1Q9NRF2 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SH2B1Q9NRF2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SH2B1Q9NRF2 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SH2B1Q9NRF2 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SH2B1Q9NRF2 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SH2B1Q9NRF2 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SH2B1Q9NRF2 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SH2B1Q9NRF2 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SH2B1Q9NRF2 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SH2B1Q9NRF2 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SH2B1Q9NRF2 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SH2B1Q9NRF2 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SH2B1Q9NRF2 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SH2B1Q9NRF2 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SH2B1Q9NRF2 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SH2B1Q9NRF2 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SH2B1Q9NRF2 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SH2B1Q9NRF2 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SH2B1Q9NRF2 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH2B1Q9NRF2 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH2B1Q9NRF2 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH2B1Q9NRF2 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH2B1Q9NRF2 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH2B1Q9NRF2 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH2B1Q9NRF2 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH2B1Q9NRF2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH2B1Q9NRF2 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH2B1Q9NRF2 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH2B1Q9NRF2 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms