Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR31

SAR1A, GTP-binding protein SAR1a, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAR1AQ9NR31 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SAR1AQ9NR31 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SAR1AQ9NR31 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SAR1AQ9NR31 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SAR1AQ9NR31 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SAR1AQ9NR31 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SAR1AQ9NR31 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SAR1AQ9NR31 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SAR1AQ9NR31 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SAR1AQ9NR31 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SAR1AQ9NR31 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SAR1AQ9NR31 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SAR1AQ9NR31 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SAR1AQ9NR31 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SAR1AQ9NR31 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SAR1AQ9NR31 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SAR1AQ9NR31 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SAR1AQ9NR31 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SAR1AQ9NR31 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SAR1AQ9NR31 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SAR1AQ9NR31 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SAR1AQ9NR31 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SAR1AQ9NR31 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SAR1AQ9NR31 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SAR1AQ9NR31 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SAR1AQ9NR31 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SAR1AQ9NR31 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SAR1AQ9NR31 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SAR1AQ9NR31 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SAR1AQ9NR31 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SAR1AQ9NR31 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SAR1AQ9NR31 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SAR1AQ9NR31 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SAR1AQ9NR31 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SAR1AQ9NR31 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SAR1AQ9NR31 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SAR1AQ9NR31 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SAR1AQ9NR31 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SAR1AQ9NR31 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SAR1AQ9NR31 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SAR1AQ9NR31 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SAR1AQ9NR31 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SAR1AQ9NR31 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SAR1AQ9NR31 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SAR1AQ9NR31 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SAR1AQ9NR31 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SAR1AQ9NR31 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SAR1AQ9NR31 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SAR1AQ9NR31 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SAR1AQ9NR31 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SAR1AQ9NR31 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SAR1AQ9NR31 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SAR1AQ9NR31 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SAR1AQ9NR31 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SAR1AQ9NR31 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SAR1AQ9NR31 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SAR1AQ9NR31 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SAR1AQ9NR31 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SAR1AQ9NR31 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SAR1AQ9NR31 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SAR1AQ9NR31 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SAR1AQ9NR31 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SAR1AQ9NR31 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SAR1AQ9NR31 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SAR1AQ9NR31 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SAR1AQ9NR31 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SAR1AQ9NR31 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SAR1AQ9NR31 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SAR1AQ9NR31 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SAR1AQ9NR31 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SAR1AQ9NR31 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SAR1AQ9NR31 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SAR1AQ9NR31 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SAR1AQ9NR31 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SAR1AQ9NR31 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SAR1AQ9NR31 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SAR1AQ9NR31 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SAR1AQ9NR31 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SAR1AQ9NR31 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SAR1AQ9NR31 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SAR1AQ9NR31 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SAR1AQ9NR31 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SAR1AQ9NR31 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SAR1AQ9NR31 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SAR1AQ9NR31 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SAR1AQ9NR31 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SAR1AQ9NR31 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SAR1AQ9NR31 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SAR1AQ9NR31 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SAR1AQ9NR31 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SAR1AQ9NR31 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SAR1AQ9NR31 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SAR1AQ9NR31 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SAR1AQ9NR31 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SAR1AQ9NR31 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SAR1AQ9NR31 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SAR1AQ9NR31 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SAR1AQ9NR31 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SAR1AQ9NR31 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SAR1AQ9NR31 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms