Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU9

BRMS1, Breast cancer metastasis-suppressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1Q9HCU9 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRMS1Q9HCU9 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRMS1Q9HCU9 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms